205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1680 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  30.18 
 
 
344 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  26.78 
 
 
333 aa  122  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  32.73 
 
 
352 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  30.03 
 
 
363 aa  106  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  32.69 
 
 
372 aa  105  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  32.69 
 
 
372 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  32.69 
 
 
372 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  31.14 
 
 
355 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  29.25 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 
349 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  32.17 
 
 
350 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  30.66 
 
 
351 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
358 aa  94  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  28.41 
 
 
347 aa  93.2  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  29.24 
 
 
357 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  29.24 
 
 
354 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  30.67 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  29.11 
 
 
356 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  28.04 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  32.86 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  30.29 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.86 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.17 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  29.86 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  29.86 
 
 
396 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  29.22 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  29.22 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  29.86 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  27.46 
 
 
372 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  26.61 
 
 
346 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  30.48 
 
 
380 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  29.27 
 
 
356 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  33.16 
 
 
354 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 
330 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  27.61 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  29.38 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  29.38 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  29.9 
 
 
372 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  29.06 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  31.36 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  26.2 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  26.95 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  28.81 
 
 
349 aa  65.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  26.95 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  25.34 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  23.26 
 
 
328 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  25.98 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.87 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  26.06 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  25.98 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  25.69 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  25.98 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  25.98 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  26.38 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  25.98 
 
 
303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  25.98 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 
310 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.7 
 
 
303 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.7 
 
 
303 aa  62.4  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.7 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.7 
 
 
303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.7 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  32.29 
 
 
318 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 
302 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  25.17 
 
 
303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  25.59 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.17 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.17 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  25.98 
 
 
303 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.61 
 
 
290 aa  59.7  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  28.73 
 
 
305 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 
314 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.91 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  23.21 
 
 
315 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  27.86 
 
 
294 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 
287 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  28.92 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.27 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  26.47 
 
 
301 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1415  integral membrane protein  28.46 
 
 
305 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123619  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 
302 aa  55.8  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1524  hypothetical protein  27.41 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0367  hypothetical protein  27.41 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00833341  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  22.18 
 
 
330 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1462  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 
333 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  25.86 
 
 
330 aa  53.1  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 
300 aa  53.1  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  27.91 
 
 
295 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.43 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2803  hypothetical protein  27.57 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  25.78 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>