54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0661 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  603  9.999999999999999e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  39.86 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  35.29 
 
 
363 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  42.92 
 
 
280 aa  149  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  35.79 
 
 
355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  38.96 
 
 
349 aa  146  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.96 
 
 
349 aa  146  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  36.39 
 
 
353 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  38.69 
 
 
350 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  34.77 
 
 
344 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  36.72 
 
 
372 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  36.72 
 
 
372 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  36.72 
 
 
372 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  37.27 
 
 
357 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.83 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.84 
 
 
350 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.01 
 
 
358 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.68 
 
 
302 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.74 
 
 
353 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 
348 aa  136  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  37.99 
 
 
372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  34.39 
 
 
354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  33.91 
 
 
372 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.15 
 
 
352 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.14 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  35.98 
 
 
353 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  37.55 
 
 
353 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  38.04 
 
 
351 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  38.04 
 
 
356 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  32.16 
 
 
356 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  36.96 
 
 
351 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  34.51 
 
 
380 aa  119  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  35.71 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  34.91 
 
 
353 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  34.91 
 
 
353 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  31.62 
 
 
396 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  30.19 
 
 
346 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  31.62 
 
 
356 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  31.62 
 
 
356 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  31.27 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  31.27 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  31.27 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  34.48 
 
 
354 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  38.24 
 
 
318 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  31.42 
 
 
349 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 
347 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  28.73 
 
 
347 aa  105  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.98 
 
 
323 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.64 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  35.04 
 
 
352 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  28.98 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.81 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  26.94 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  24.03 
 
 
293 aa  53.9  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>