66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1145 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1145  membrane protein  100 
 
 
380 aa  739    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.351229  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0280  membrane protein  93.56 
 
 
396 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1009  membrane protein  93.54 
 
 
356 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1721  putative transporter  93.54 
 
 
356 aa  548  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0542336  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0288  membrane protein  93.28 
 
 
358 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212886  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1308  membrane protein  93.26 
 
 
356 aa  544  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1806  hypothetical protein  93.26 
 
 
356 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7079  protein of unknown function DUF6 transmembrane  77.12 
 
 
353 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7729  hypothetical protein  74.86 
 
 
353 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1548  hypothetical protein  73.56 
 
 
356 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0196  DMT family permease  75.99 
 
 
354 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6009  hypothetical protein  74.86 
 
 
372 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5765  hypothetical protein  75.71 
 
 
353 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125359  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.39 
 
 
356 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5819  hypothetical protein  74.17 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211958  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6184  hypothetical protein  74.17 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6663  hypothetical protein  73.57 
 
 
353 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190616  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1523  hypothetical protein  64.89 
 
 
351 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6211  hypothetical protein  66.96 
 
 
351 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1737  hypothetical protein  60.96 
 
 
350 aa  355  5.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.53806 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1582  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.01 
 
 
352 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85021  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.82 
 
 
348 aa  348  9e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.760576  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2405  hypothetical protein  54.87 
 
 
352 aa  344  1e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1044  cobalt-nickel-resistance system transmembrane protein  69.73 
 
 
352 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.935622  normal  0.258004 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0090  hypothetical protein  62.43 
 
 
354 aa  335  7.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.196986  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.78 
 
 
358 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2249  hypothetical protein  59.48 
 
 
350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.660047  normal  0.735627 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2103  hypothetical protein  52.63 
 
 
372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2356  integral membrane protein  52.63 
 
 
372 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622211  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1993  integral membrane protein  52.63 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.191087  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2188  hypothetical protein  54.73 
 
 
349 aa  299  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00735696  normal  0.566417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3964  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59 
 
 
347 aa  292  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2052  hypothetical protein  52.39 
 
 
349 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1711  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.39 
 
 
349 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4009  hypothetical protein  53.49 
 
 
372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7402  hypothetical protein  53.2 
 
 
356 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.718742  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3456  hypothetical protein  45.14 
 
 
346 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1945  twin-arginine translocation pathway signal  53.97 
 
 
318 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3480  hypothetical protein  52.69 
 
 
357 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1337  hypothetical protein  42.9 
 
 
344 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132774  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0033  hypothetical protein  40.91 
 
 
363 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.586052  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.4 
 
 
347 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2294  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.14 
 
 
350 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000455657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2204  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.8 
 
 
330 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000373443 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  38.75 
 
 
355 aa  207  3e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0451  hypothetical protein  38.62 
 
 
350 aa  190  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1362  hypothetical protein  44.16 
 
 
280 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.33 
 
 
323 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0673  hypothetical protein  31.89 
 
 
347 aa  160  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0016  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.49 
 
 
302 aa  152  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0401705 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5757  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 
351 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0661  hypothetical protein  34.93 
 
 
312 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1680  hypothetical protein  30.17 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0463  hypothetical protein  24.72 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000101678 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4940  hypothetical protein  55.38 
 
 
92 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  28.16 
 
 
311 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  32.02 
 
 
311 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1412  membrane spanning protein  26.74 
 
 
338 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  28.49 
 
 
330 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  28.12 
 
 
313 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.56 
 
 
315 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  35.79 
 
 
294 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  30.85 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  46.88 
 
 
331 aa  43.1  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2598  hypothetical protein  24.89 
 
 
303 aa  43.1  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  29.04 
 
 
328 aa  42.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>