86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2598 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2598  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  592  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0356  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.55 
 
 		 296 aa  350  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0762  hypothetical protein  63.86 
 
 		 295 aa  339  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3876  hypothetical protein  58.86 
 
 		 301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.946212  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3452  membrane protein  42.42 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2825  integral membrane protein  33.45 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2912  hypothetical protein  33.1 
 
 		 293 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4052  membrane protein  28.83 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1716  hypothetical protein  28.63 
 
 		 292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.889614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2730  membrane protein  25.51 
 
 		 291 aa  94.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0502  hypothetical protein  26.73 
 
 		 319 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.03 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  27.21 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  25.7 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  23.67 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  20.49 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  22.85 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  19.39 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  29.07 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.67 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  27.66 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  23.33 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  19.39 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  22.57 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  23.33 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  22.56 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  20.08 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  20.6 
 
 		 219 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  23.98 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  26.54 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  23.53 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  28.47 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.24 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  24.37 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.71 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  30.11 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.03 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.1 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  22.1 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.33 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.47 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4387  EamA family protein  28.05 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4605  transporter, EamA family  28.05 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4726  eama family protein  28.05 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  21.25 
 
 		 309 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4240  drug/metabolite exporter family protein  28.05 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 		 311 aa  49.7  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  24.16 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.51 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0036  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.8 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  26.32 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  24.12 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.81 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  26.32 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  22.56 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1426  hypothetical protein  24.88 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  24.84 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  24.84 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  24.84 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  24.84 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  24.84 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  24.84 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  24.84 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.42 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  25.1 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  22.57 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  22.22 
 
 		 336 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  28.17 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1236  hypothetical protein  30.61 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000572189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.943556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  25 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  22.14 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  27.54 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  33.13 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  27.22 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.6 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  25.17 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  25.29 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  28.3 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  22.95 
 
 		 313 aa  42.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  28.3 
 
 		 331 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  25.51 
 
 		 283 aa  42.4  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  28.3 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>