36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0356 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0356  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2598  hypothetical protein  66.55 
 
 		 303 aa  355  6.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0762  hypothetical protein  64.1 
 
 		 295 aa  333  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3876  hypothetical protein  59.71 
 
 		 301 aa  287  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.946212  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3452  membrane protein  38.31 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4052  membrane protein  30.43 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1716  hypothetical protein  27.74 
 
 		 292 aa  95.9  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.889614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2912  hypothetical protein  27.87 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2825  integral membrane protein  27.53 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2730  membrane protein  26.44 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0502  hypothetical protein  24.44 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.25 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.25 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.38 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  22.05 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  24.1 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  24.21 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  24.71 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  24.03 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  23.08 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  22.86 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  23.74 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  25.12 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  24.9 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.66 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  25.53 
 
 		 313 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  25.78 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  25.9 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  22.86 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2406  DMT family permease  22.22 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  21.31 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  27.6 
 
 		 341 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.46 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>