166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2912 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2912  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2825  integral membrane protein  98.29 
 
 		 293 aa  570  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1716  hypothetical protein  41.38 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.889614  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2598  hypothetical protein  33.1 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0762  hypothetical protein  30.42 
 
 		 295 aa  129  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4052  membrane protein  34.12 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3876  hypothetical protein  31.91 
 
 		 301 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.946212  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0356  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.41 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3452  membrane protein  29.41 
 
 		 317 aa  99.4  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2730  membrane protein  26.07 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  26.94 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  27.27 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  26.76 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25.55 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.82 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0502  hypothetical protein  27 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  23.11 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  21.83 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  27.24 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  21.86 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  27.31 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  20.53 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.94 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.943556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  26.24 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.78 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  22.76 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  26.24 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  23.6 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  27.31 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  26.04 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  23.98 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.69 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  25.74 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  24.48 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  25.4 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  23.79 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  22.73 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  22.91 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.26 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  23.86 
 
 		 297 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  22.26 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  23.94 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  22.78 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2905  hypothetical protein  25.17 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  23.32 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  23.67 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  22.44 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  23.83 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  21.95 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  24.43 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  21.95 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  23.41 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  21.95 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  21.46 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  22.39 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  21.46 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.28 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  21.46 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.44 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  24.74 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  23.88 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  21.95 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  21.95 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  22.05 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  23.71 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  24.9 
 
 		 316 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  28.18 
 
 		 317 aa  53.1  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.79 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.34 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0463  hypothetical protein  23.79 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.57 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  27.31 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  22.85 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  24.38 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.53 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.69 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  24.02 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.61 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  21.74 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  21.76 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  24.38 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  23.26 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  22.16 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.65 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  29.21 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.48 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.63 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.42 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  23.78 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>