65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0502 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0502  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  626  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2730  membrane protein  43.71 
 
 
291 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4052  membrane protein  27.04 
 
 
297 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2598  hypothetical protein  27.18 
 
 
303 aa  86.7  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488071 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1716  hypothetical protein  26.43 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.889614  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3452  membrane protein  27.2 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0356  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0762  hypothetical protein  23.97 
 
 
295 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.42 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  23.05 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2912  hypothetical protein  26.24 
 
 
293 aa  59.3  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  25 
 
 
311 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  23.33 
 
 
309 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.09 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  22.63 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  26.39 
 
 
286 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2825  integral membrane protein  25.48 
 
 
293 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  26.8 
 
 
286 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  23.53 
 
 
305 aa  55.8  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.9 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3876  hypothetical protein  22.78 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.946212  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  24.83 
 
 
331 aa  53.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.08 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.49 
 
 
289 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  23.98 
 
 
335 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  21.9 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 
286 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  24.16 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  24.21 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  25.47 
 
 
325 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  25.94 
 
 
310 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  27.76 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  24.19 
 
 
306 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  24.54 
 
 
309 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  23.24 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  22.13 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  22.68 
 
 
301 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  21.16 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  20.98 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  24.86 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  22.03 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  22.99 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  25.88 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  22.82 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  28.44 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  21.33 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  21.33 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  23.42 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  21.33 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  22.82 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  21.33 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  21.33 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  22.41 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  22.41 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  22.41 
 
 
303 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  25.94 
 
 
345 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  28.19 
 
 
341 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  22.92 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  24.52 
 
 
293 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  22.41 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1657  hypothetical protein  25.09 
 
 
307 aa  42.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.907387  normal  0.515253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  26.97 
 
 
303 aa  42.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>