157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4052 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4052  membrane protein  100 
 
 		 297 aa  592  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0762  hypothetical protein  32.54 
 
 		 295 aa  140  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0356  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.46 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3876  hypothetical protein  30.71 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.946212  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2598  hypothetical protein  28.83 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488071 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2825  integral membrane protein  34.12 
 
 		 293 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2912  hypothetical protein  34.12 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2730  membrane protein  29.52 
 
 		 291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0502  hypothetical protein  27.6 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1716  hypothetical protein  29.63 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.889614  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3452  membrane protein  26.67 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.92 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.84 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  25 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.58 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.98 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.41 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  24.06 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  29.75 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  23.48 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.1 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  25.1 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  25.46 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  23.48 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  23.11 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24.74 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  24.39 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  29.17 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  26.77 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  28.32 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  27.32 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  25.87 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  29.7 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  29.17 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  29.17 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  29.17 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  29.17 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  29.17 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  29.17 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  25.48 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  22.19 
 
 		 296 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  24.02 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  22.85 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.38 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  29.17 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  23.87 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  27.94 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  24.24 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  25.38 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.39 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  23.66 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  22.41 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  24.61 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2905  hypothetical protein  24.81 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  28.16 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  26.51 
 
 		 325 aa  55.8  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  24.8 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.75 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal  0.0433001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  22.37 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  27.61 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  22.37 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  23.48 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  23.05 
 
 		 329 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  22.7 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  22.46 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.73 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.73 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.95 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2079  hypothetical protein  80.65 
 
 		 47 aa  52.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.666985 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  26.19 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3611  hypothetical protein  27.06 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603638  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  27.23 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  27 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  27.12 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.26 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  27.23 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  21.56 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  27 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  23.78 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  26.17 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  21.77 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  24.8 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3902  hypothetical protein  23.24 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.773994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  23.02 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  22.22 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  27.86 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.89 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>