More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6116 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 330 aa  637    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal  0.0433001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  67.47 
 
 		 309 aa  355  6.999999999999999e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  27.1 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  27.42 
 
 		 309 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  27.05 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  27.24 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.83 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  31.44 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  31.19 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  33.77 
 
 		 311 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  32.54 
 
 		 328 aa  95.9  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.99 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0036  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.83 
 
 		 292 aa  89.4  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.99 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.35 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  28.67 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28.96 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.86 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  28.62 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  31.1 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  30.77 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  22.11 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.3 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  28.36 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.3 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  21.62 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  21.89 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  24.11 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  21.23 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.57 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  21.89 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  21.81 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  21.81 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  21.62 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  27.34 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  24.47 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3809  integral membrane protein  25.69 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.770617  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  21.48 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  28.67 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  30.14 
 
 		 294 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  27.72 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  28.2 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  27.34 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  24.11 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  27.3 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  24.11 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  24.11 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  23.62 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  29.43 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  22.4 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  24.11 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3184  hypothetical protein  27.7 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.546579  normal  0.703778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  23.3 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  27.33 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  23.76 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  23.88 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  23.88 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  23.88 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  23.88 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  24.38 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  23.38 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.12 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  22.78 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2406  DMT family permease  26.41 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  24.51 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  30.8 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  30.53 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.59 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  28.28 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  31.65 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.54 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3401  hypothetical protein  28.52 
 
 		 322 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0214667 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  26.67 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.8 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  25.77 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.33 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  23.88 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  23.04 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.87 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  23.38 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  22.89 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  28.42 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  24.83 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>