298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2406 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2406  DMT family permease  100 
 
 
304 aa  609  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02540  hypothetical protein  34.16 
 
 
304 aa  142  5e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.873366  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  29.37 
 
 
304 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  28.94 
 
 
303 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  28.62 
 
 
303 aa  99  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  28.62 
 
 
303 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  28.62 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  28.62 
 
 
303 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  28.62 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  29.07 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  28.85 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  28.53 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  25.17 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  28.12 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  24.84 
 
 
312 aa  85.9  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  23.57 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.45 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  28.83 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  24.31 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  26.17 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  29.15 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  28.19 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  29.15 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  29.27 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  29.27 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  27.13 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  27.33 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  28.1 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.72 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  22.86 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  22.45 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.77 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  24.39 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.89 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  22.94 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  21.4 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.88 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4387  EamA family protein  22.41 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4240  drug/metabolite exporter family protein  22.41 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4726  eama family protein  22.41 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4605  transporter, EamA family  22.41 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  23.83 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  23.81 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.49 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  23.81 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  24.77 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.27 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2946  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.33 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  23.03 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  22.71 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  23.96 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  25.71 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.36 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.11 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  23.44 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  26.55 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  23.51 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  26.11 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  24.36 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  26.55 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  24.77 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  26.55 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  23.22 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  25.89 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  26.55 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  23.11 
 
 
306 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  26.36 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.6 
 
 
317 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  26.55 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  24.36 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  26.11 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6116  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 
330 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51682  normal  0.0433001 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  26.11 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.73 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  20.96 
 
 
329 aa  63.9  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  23.33 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.89 
 
 
286 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.59 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.36 
 
 
306 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  21.86 
 
 
309 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.41 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.14 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  22.64 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.46 
 
 
325 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.72 
 
 
292 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  22.26 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  25.72 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 
289 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  22.28 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  23.83 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  26.87 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  23.81 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  19.4 
 
 
348 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  23.31 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  22.91 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  22.91 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  22.91 
 
 
299 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>