More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2110 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  97.68 
 
 		 302 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  94.04 
 
 		 302 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  94.04 
 
 		 302 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  93.71 
 
 		 302 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  93.38 
 
 		 297 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  88.59 
 
 		 299 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  88.59 
 
 		 299 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  88.59 
 
 		 299 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  86.91 
 
 		 299 aa  481  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  88.41 
 
 		 299 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  75.95 
 
 		 286 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  75.17 
 
 		 299 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  64.63 
 
 		 308 aa  362  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  65.97 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  65.29 
 
 		 302 aa  342  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.36 
 
 		 312 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.04 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  87.42 
 
 		 154 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  87.42 
 
 		 154 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1083  putative integral membrane protein  90.65 
 
 		 143 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0791  multidrug ABC transporter permease  90.65 
 
 		 143 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.92484  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  42.52 
 
 		 320 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  41.14 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  42.33 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.76 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  43.45 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  41.75 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  41.95 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  41 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.16 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  40.78 
 
 		 318 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  42.03 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.19 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.75 
 
 		 286 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.62 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.62 
 
 		 305 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  31.46 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  35.95 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  34.24 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.87 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  30.64 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  30.2 
 
 		 304 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  31.67 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  31.67 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  31.68 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  31.08 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  33.89 
 
 		 309 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  30.36 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  30.36 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  30.36 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  29.18 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  32.11 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  32.65 
 
 		 288 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.9 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  33.23 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  29.43 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  30.94 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  29.5 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  31.51 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  30.11 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  28.43 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  29.5 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  30.47 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  30.47 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  30.47 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  30.11 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  31.16 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  29.14 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  29.14 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  28.47 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.2 
 
 		 299 aa  89.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.88 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  32.68 
 
 		 268 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  32.68 
 
 		 268 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  32.68 
 
 		 268 aa  89.4  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  35.2 
 
 		 236 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25.68 
 
 		 313 aa  85.5  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.52 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.57 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.52 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.73 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.97 
 
 		 308 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  25.27 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  27.85 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.09 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  23.61 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  30.07 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  25.74 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  28.18 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  27.63 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  27.69 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>