More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1447 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  70.9 
 
 		 301 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  70.9 
 
 		 301 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  50.86 
 
 		 308 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  51.02 
 
 		 300 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  45.99 
 
 		 296 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.24 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.14 
 
 		 301 aa  252  6e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.31 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  42.32 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  42.09 
 
 		 330 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.88 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.26 
 
 		 303 aa  188  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.53 
 
 		 355 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0478  hypothetical protein  36.33 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.93 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.93 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  30.29 
 
 		 304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.62 
 
 		 299 aa  108  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 315 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.69 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  28.03 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  27.08 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  31.22 
 
 		 297 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  28.38 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  26.57 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  31.14 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  26.74 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  27.14 
 
 		 313 aa  92.8  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  30.99 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  28.67 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  26.74 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  27.31 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  27.49 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  30.99 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  30.99 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  30.58 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  34.11 
 
 		 330 aa  90.1  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  30.21 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  30.63 
 
 		 310 aa  89.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  29.88 
 
 		 302 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  30.6 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  26.13 
 
 		 303 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  26.48 
 
 		 303 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0210  hypothetical protein  30.86 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000588451  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  26.48 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  25.71 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.83 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  31.12 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.78 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  26.57 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  31.12 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  33.19 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  29.18 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  31.12 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.05 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  26.22 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.87 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  26.22 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.69 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  27.74 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  34.11 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.87 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  30.88 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.69 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  31 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  30.71 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  23.7 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  27.55 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.87 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.82 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  31.64 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  26.04 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  32.16 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.95 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  34.92 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  29.05 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  31.72 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  31.06 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.69 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.84 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  30.9 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  33.03 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  30.42 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  31.06 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1447  hypothetical protein  25.09 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000141757  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.42 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  28.96 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  28.94 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>