More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1807 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
320 aa  635    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  73.08 
 
 
300 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  64.71 
 
 
308 aa  388  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.92 
 
 
330 aa  289  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  52.57 
 
 
301 aa  276  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  53.17 
 
 
301 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  53.17 
 
 
301 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.95 
 
 
301 aa  261  1e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  42.86 
 
 
296 aa  248  9e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  41.52 
 
 
330 aa  215  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.16 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.05 
 
 
300 aa  207  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.82 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  39.74 
 
 
317 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0478  hypothetical protein  41.39 
 
 
322 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  30.91 
 
 
299 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.2 
 
 
315 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
283 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.34 
 
 
305 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 
305 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  30.13 
 
 
295 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 
305 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  29.05 
 
 
305 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
287 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  30.77 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  28.67 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  30.29 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.12 
 
 
304 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  27.65 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  27.45 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.94 
 
 
303 aa  92.4  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  27.81 
 
 
305 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.97 
 
 
299 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25 
 
 
312 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25.71 
 
 
307 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.92 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  27.82 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  28.66 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  30.86 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.38 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  26.54 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  29.9 
 
 
296 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  31.25 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  26.33 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  27.39 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  30.2 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  27.83 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  28.18 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  30.31 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  26.15 
 
 
306 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.24 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  29.37 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  30.35 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  25.99 
 
 
297 aa  85.9  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.58 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  31.25 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.87 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  30.57 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.85 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  29.96 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  29.96 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25.62 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  30.43 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.46 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  30.47 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  28.67 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  29.6 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.3 
 
 
306 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  29.44 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.56 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  29.79 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  28.04 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  28.04 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  28.04 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 
286 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  31.47 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  28.11 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  27.46 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  25.98 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  28.32 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  28.14 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  30.56 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  28.11 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  26.67 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  28.24 
 
 
299 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  28.38 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  28.33 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  29.43 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1447  hypothetical protein  26.57 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000141757  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  26.73 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.75 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  26.74 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.21 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  27.3 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>