More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3019 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  44.78 
 
 
300 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.64 
 
 
320 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.04 
 
 
330 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  40.61 
 
 
308 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  42.77 
 
 
301 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  43.48 
 
 
301 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2387  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.39 
 
 
303 aa  206  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000106611  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.48 
 
 
300 aa  205  9e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  41.95 
 
 
301 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.93 
 
 
301 aa  203  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.99 
 
 
355 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0478  hypothetical protein  42.27 
 
 
322 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  34.21 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.67 
 
 
283 aa  138  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1205  hypothetical protein  31.96 
 
 
317 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0875949  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  29.93 
 
 
307 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.77 
 
 
299 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 
304 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  31.01 
 
 
313 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  27.92 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.8 
 
 
305 aa  99.4  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  29.11 
 
 
305 aa  99.4  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  33 
 
 
289 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6176  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.85 
 
 
315 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.090411 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  27.89 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1447  hypothetical protein  26.55 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000141757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.9 
 
 
311 aa  87  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2167  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.65 
 
 
313 aa  86.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  27.4 
 
 
312 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  25.56 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.33 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  24.84 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.3 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  27.12 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.41 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 
309 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  30.45 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.98 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  29.89 
 
 
330 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  25.93 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  27.12 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1447  hypothetical protein  27 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  27.16 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  30.2 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  26.19 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  27.24 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  25.09 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  27.9 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.96 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  26.77 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  26.95 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  26.76 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.03 
 
 
293 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  26.99 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  26.6 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.1 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  27.39 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  28.17 
 
 
319 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  27.63 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  29.05 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  25.44 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  26.73 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  24.44 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  25.44 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  24.65 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  27.15 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  22.49 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.943556  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  24.65 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  28.25 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  25.51 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1472  DMT family permease  24.91 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00237302  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1727  hypothetical protein  25.44 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  25.44 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.26 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  28.25 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  29.75 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  28.34 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  26 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  26.6 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.13 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  25.5 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  28.96 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  29.19 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  27.62 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  25.65 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  24.74 
 
 
329 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  30.39 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>