122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3452 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3452  membrane protein  100 
 
 		 317 aa  630  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2598  hypothetical protein  40.91 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488071 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3876  hypothetical protein  40.94 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.946212  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0762  hypothetical protein  38.46 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0356  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.31 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2825  integral membrane protein  29.9 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1716  hypothetical protein  25.19 
 
 		 292 aa  96.3  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.889614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2912  hypothetical protein  29.41 
 
 		 293 aa  96.3  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2730  membrane protein  27.57 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4052  membrane protein  25.78 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0502  hypothetical protein  27.54 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  28.14 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  28.76 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  28.14 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  27.11 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  23.11 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  27.35 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  28.51 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  29.19 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  22.49 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  28.11 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  28.11 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  28.11 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  27.57 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  24.58 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  22.94 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  23.3 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  26.63 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  26.23 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  23.67 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  26.94 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  27.81 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  22.41 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.3 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  22.94 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  23.78 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  26.94 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  24.87 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  25.75 
 
 		 293 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  22.99 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.16 
 
 		 286 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  22.83 
 
 		 309 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  26.25 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  26.11 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  29.85 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  27.16 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  25.32 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  29.76 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  26.15 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  29.57 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.06 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  21.98 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  31.22 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  31.22 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  23.13 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  31.22 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  31.22 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  31.22 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  31.22 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.27 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  21.86 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  21.86 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  21.61 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  25.1 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  22.75 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  24.17 
 
 		 331 aa  49.3  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  24.62 
 
 		 322 aa  49.3  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.69 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  21.25 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  22.57 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  26.78 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  21.51 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.69 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  20.43 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  21.51 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  24.17 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.6 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  21.25 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  20.43 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  21.15 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.28 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  26.75 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.97 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.65 
 
 		 292 aa  47  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  25.62 
 
 		 303 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2227  hypothetical protein  23.6 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000184555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  26.09 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  26.09 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  26.09 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  25.18 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  38.1 
 
 		 154 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  38.1 
 
 		 154 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  25.34 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  25.18 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>