112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2730 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2730  membrane protein  100 
 
 		 291 aa  576  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0502  hypothetical protein  43.71 
 
 		 319 aa  208  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4052  membrane protein  29.1 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1716  hypothetical protein  27.56 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.889614  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0356  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0762  hypothetical protein  24.9 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3452  membrane protein  27.8 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2598  hypothetical protein  24.83 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00488071 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3876  hypothetical protein  23.51 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.946212  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2825  integral membrane protein  26.07 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2912  hypothetical protein  26.07 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  26.64 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  26.64 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  27.27 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  23.74 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  27.35 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  27.35 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  27.35 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.74 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  26.92 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  27.78 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  26.41 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  26.5 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  25.97 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  25.33 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  26.41 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  26.84 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  25.57 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.14 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 		 317 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.17 
 
 		 311 aa  52.4  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  21.81 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6885  hypothetical protein  25.61 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  25 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.55 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  25.1 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  22.85 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4910  hypothetical protein  25.65 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000131826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.3 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4853  hypothetical protein  24.38 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55720  hypothetical protein  24.9 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  24.69 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  24.37 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02196  hypothetical protein  25.14 
 
 		 297 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  22.52 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.3 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  24.44 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.94 
 
 		 303 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.94 
 
 		 303 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.95 
 
 		 291 aa  48.9  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  26.41 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1521  hypothetical protein  25.98 
 
 		 266 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.851073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4854  hypothetical protein  26.01 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  21.97 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  22.94 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.86 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  22.5 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  22.99 
 
 		 322 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.22 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.95 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7072  hypothetical protein  25.3 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  22.58 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  21.13 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  24.63 
 
 		 330 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  24.74 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  24.27 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  22.58 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  21.79 
 
 		 311 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  23.77 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  24.14 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  27.05 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.58 
 
 		 303 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.41 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  26.46 
 
 		 301 aa  46.2  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  20.77 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3842  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.92 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.319423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4919  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.92 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  22.13 
 
 		 341 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  27.06 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4645  hypothetical protein  26.02 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430538  normal  0.037772 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  25.18 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.41 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  25.12 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.8 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.71 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.79 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  24.91 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  24.1 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6774  hypothetical protein  25.45 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12940  membrane protein  26.83 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000993304  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  22.18 
 
 		 336 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4901  hypothetical protein  27.07 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0572  hypothetical protein  27.15 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.927387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  19.75 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1230  hypothetical protein  26.87 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.112754 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  25.93 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  22.81 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>