53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0762 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0762  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  565  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2598  hypothetical protein  63.86 
 
 
303 aa  346  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0356  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.1 
 
 
296 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.469708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3876  hypothetical protein  60.07 
 
 
301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.946212  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3452  membrane protein  37.65 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4052  membrane protein  31.67 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2825  integral membrane protein  29.82 
 
 
293 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2912  hypothetical protein  29.82 
 
 
293 aa  119  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1716  hypothetical protein  27.04 
 
 
292 aa  99.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.889614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2730  membrane protein  25.52 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0502  hypothetical protein  23.97 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.08 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  23.9 
 
 
293 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  23.36 
 
 
309 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  34.62 
 
 
341 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.32 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  25.32 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  25.32 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  25.95 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  27.31 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  21.72 
 
 
309 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1938  hypothetical protein  23.87 
 
 
309 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.94685  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  24.89 
 
 
310 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  52.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  22.16 
 
 
219 aa  52.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  25.14 
 
 
309 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  22.13 
 
 
311 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  22.54 
 
 
309 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.62 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.82 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.75 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  26.32 
 
 
312 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  26.8 
 
 
325 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.06 
 
 
325 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.19 
 
 
315 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  25.5 
 
 
308 aa  45.8  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.04 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  23.93 
 
 
297 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.48 
 
 
312 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.49 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  37.97 
 
 
294 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.14 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.36 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  21.49 
 
 
301 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  24.05 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  24.06 
 
 
312 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  24.06 
 
 
312 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  24.06 
 
 
312 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  24.06 
 
 
312 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  24.06 
 
 
312 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  24.06 
 
 
312 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  24.06 
 
 
312 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  24.07 
 
 
303 aa  42.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>