287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3580 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  568  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  58.76 
 
 		 296 aa  321  9.000000000000001e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  60.14 
 
 		 294 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.72 
 
 		 295 aa  315  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  57.99 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.7 
 
 		 294 aa  295  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  60.64 
 
 		 294 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  57.14 
 
 		 288 aa  292  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.25 
 
 		 296 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  60.45 
 
 		 290 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  56.36 
 
 		 290 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.82 
 
 		 288 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  54.33 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  56.6 
 
 		 288 aa  262  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  56.46 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  55.82 
 
 		 298 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  54.04 
 
 		 284 aa  254  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  59.39 
 
 		 289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  47.95 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  46.98 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  46.98 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  45.64 
 
 		 314 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  46.98 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  41.81 
 
 		 314 aa  152  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.49 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  40.14 
 
 		 280 aa  142  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  43.6 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  40.75 
 
 		 289 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  36.74 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  33 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.25 
 
 		 281 aa  86.3  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  28.89 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3219  hypothetical protein  50 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  30 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.15 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  32.95 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  26.94 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  28.97 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  26.04 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.96 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  29.43 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  29.6 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.57 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1257  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  24.91 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  26.84 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  24.75 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  26.84 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  28.3 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  25.61 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  26 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  26.47 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  24.41 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  27.01 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  25.71 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.58 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  24.75 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  27.04 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  24.75 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.33 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  25.91 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  28.33 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  27.99 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3485  hypothetical protein  28.33 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000551734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  26.67 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1026  hypothetical protein  27.99 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.715879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  27.93 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  25.37 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  35.9 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  25.37 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  25.37 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  29.54 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.82 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  29.78 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.94 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  30.7 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  30.7 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  26.17 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  24.63 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.26 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  23.55 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.21 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  26.59 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  29.05 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  29.5 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  28.95 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  30.41 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1239  hypothetical protein  24.41 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000937843  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4555  hypothetical protein  25.67 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3483  hypothetical protein  25.67 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  0.164721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  26.47 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.3 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.84 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  26.62 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3469  hypothetical protein  28.89 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>