37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0186 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  558  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  45.3 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  34.89 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.2 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  34.2 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  30.07 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  34.23 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  28.68 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  30.39 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  30.41 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  30.67 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  31.05 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.54 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  29.92 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  29.44 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  30.69 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  29.12 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  29.57 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  30.53 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  27.97 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  29.82 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  29.82 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  30.05 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  27.49 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  31.45 
 
 		 282 aa  52.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.8 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  28.38 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  30 
 
 		 303 aa  45.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.2 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.64 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  24.89 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  27.27 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  22.1 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>