244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4998 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  586  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.87 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  61.01 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  49.49 
 
 		 304 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.88 
 
 		 294 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  50.52 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  50.18 
 
 		 284 aa  242  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  52.28 
 
 		 294 aa  242  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  49.65 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  47.95 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  47.92 
 
 		 296 aa  238  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  51.57 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.46 
 
 		 296 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  48.77 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  50.19 
 
 		 290 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  47.26 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  49.46 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.63 
 
 		 288 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  47.35 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  47.96 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  42.57 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  41.2 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  41.2 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  38.57 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  33.89 
 
 		 297 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.24 
 
 		 283 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  36.79 
 
 		 280 aa  122  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  39.36 
 
 		 282 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  35.87 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  29.05 
 
 		 293 aa  92  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.6 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3219  hypothetical protein  42.86 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  28.91 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  28.53 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  27.88 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  25.24 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  27.78 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  26.9 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2109  hypothetical protein  25.08 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0115021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  26.35 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  25.84 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  26.35 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3483  hypothetical protein  25.53 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  0.164721 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4555  hypothetical protein  25.53 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  27.04 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  25.87 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  29.41 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1370  hypothetical protein  25.08 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  0.119538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  28.26 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  25.86 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  27.4 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  23.43 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  27.83 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  26.57 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  26.57 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  26.57 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.64 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  28.76 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  26.49 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  29 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  23.03 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4075  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.06 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5633  hypothetical protein  27.75 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  23.97 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  24.34 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3885  hypothetical protein  24.29 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4484  hypothetical protein  24.29 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  24.04 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  23.97 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05416  hypothetical protein  25.45 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.22 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  22.15 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  27.31 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.12 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.49 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2070  hypothetical protein  24.77 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.53 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.53 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  23.23 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  26.06 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  22.95 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03706  predicted inner membrane protein  27.22 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4152  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.22 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  23.85 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4349  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  27.22 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  23.85 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5820  hypothetical protein  24.12 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4181  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.22 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0864049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4194  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  27.22 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4294  10 TMS Drug/Metabolite Exporter (DME) family  27.22 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03655  hypothetical protein  27.22 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4358  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.19 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4051  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  26.67 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  34.48 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.93 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 		 315 aa  53.9  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  21.51 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>