65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3483 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4555  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3483  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  0.164721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2109  hypothetical protein  80.2 
 
 		 316 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0115021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  77.78 
 
 		 328 aa  481  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4484  hypothetical protein  69.11 
 
 		 321 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3885  hypothetical protein  69.11 
 
 		 321 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5633  hypothetical protein  71.66 
 
 		 311 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5820  hypothetical protein  69.11 
 
 		 314 aa  417  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1370  hypothetical protein  66.88 
 
 		 321 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  0.119538 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1390  hypothetical protein  66.88 
 
 		 303 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  60.54 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.14 
 
 		 293 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  60.14 
 
 		 293 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  60.14 
 
 		 293 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  59.79 
 
 		 293 aa  354  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  59.79 
 
 		 293 aa  353  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  60.62 
 
 		 295 aa  345  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  60.41 
 
 		 307 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  60.75 
 
 		 293 aa  335  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  60.75 
 
 		 293 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  60.41 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  60.41 
 
 		 307 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  60.66 
 
 		 274 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  60.66 
 
 		 274 aa  333  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  60.66 
 
 		 274 aa  333  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2070  hypothetical protein  56.75 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  45.52 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  42 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  47.08 
 
 		 277 aa  261  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05416  hypothetical protein  44.07 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  45.17 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  42.11 
 
 		 308 aa  258  7e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001475  permease  44.64 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.310077  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  40.13 
 
 		 328 aa  242  7e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  43.79 
 
 		 295 aa  239  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  44.14 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  43.73 
 
 		 306 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  41.98 
 
 		 297 aa  225  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  43.84 
 
 		 318 aa  205  7e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  38.33 
 
 		 295 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1735  inner membrane protein YddG  58.33 
 
 		 162 aa  195  8.000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1026  hypothetical protein  38.33 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.715879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3485  hypothetical protein  37.98 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000551734  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3055  hypothetical protein  34.84 
 
 		 301 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  25.53 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  27.1 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  26.1 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  26.09 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  26.7 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  27.82 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  25.75 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  28.84 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  26.52 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  26.52 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  25.65 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  28.16 
 
 		 284 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  25.94 
 
 		 314 aa  49.7  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  26.28 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  24.9 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  23.2 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.05 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  26.94 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.7 
 
 		 294 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>