73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2190 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  90.38 
 
 		 295 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  67.01 
 
 		 297 aa  374  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  62.46 
 
 		 295 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  49.14 
 
 		 303 aa  301  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  52.23 
 
 		 295 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  50.52 
 
 		 293 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  50.52 
 
 		 293 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2070  hypothetical protein  58.54 
 
 		 297 aa  292  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  50.52 
 
 		 293 aa  292  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  52.63 
 
 		 305 aa  291  9e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.17 
 
 		 293 aa  290  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  48.64 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  50.17 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  50.52 
 
 		 293 aa  288  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  50.52 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  50.52 
 
 		 307 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  50.35 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  50.17 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  49.83 
 
 		 307 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  45.27 
 
 		 328 aa  271  9e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  49.14 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2109  hypothetical protein  45.58 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0115021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  49.08 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  49.08 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  49.08 
 
 		 274 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001475  permease  43.99 
 
 		 300 aa  262  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.310077  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05416  hypothetical protein  43.99 
 
 		 300 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4484  hypothetical protein  44.56 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3885  hypothetical protein  44.56 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  49.26 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5820  hypothetical protein  44.37 
 
 		 314 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3483  hypothetical protein  45.17 
 
 		 314 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  0.164721 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4555  hypothetical protein  45.17 
 
 		 314 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5633  hypothetical protein  47.22 
 
 		 311 aa  255  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1370  hypothetical protein  43.54 
 
 		 321 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  0.119538 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  47.06 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  43 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1026  hypothetical protein  47.06 
 
 		 295 aa  249  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.715879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3485  hypothetical protein  47.06 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000551734  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1390  hypothetical protein  47.57 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3055  hypothetical protein  43.64 
 
 		 301 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1735  inner membrane protein YddG  56.05 
 
 		 162 aa  175  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  38.89 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  27.14 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  29.09 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  28.09 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  27.39 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  28.84 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  27.59 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  26.97 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  27.59 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  27.99 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  29.41 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  29.48 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  26.17 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  25.95 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  25.34 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  23.33 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  30.63 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  27.27 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  29.48 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  26.44 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  32.61 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  25.57 
 
 		 303 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.99 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>