122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1798 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  630  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  45.64 
 
 
294 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  42.57 
 
 
300 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  41.53 
 
 
296 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  42.24 
 
 
298 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.47 
 
 
295 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  44.29 
 
 
284 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.33 
 
 
296 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  42.23 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  41.84 
 
 
294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.62 
 
 
294 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  43.34 
 
 
294 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  40.48 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  42.56 
 
 
290 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  39.6 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  40.28 
 
 
307 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  40.28 
 
 
307 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  40.84 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  40.89 
 
 
290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  40.77 
 
 
290 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  40.22 
 
 
289 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.67 
 
 
288 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  34.63 
 
 
280 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.91 
 
 
283 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  34.77 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  39.86 
 
 
303 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  35.79 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  30.16 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  33.59 
 
 
289 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  25.9 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.552621 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 
293 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  26.52 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  27.54 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  24.75 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  25.16 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  25.42 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  25.42 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  30.37 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  25.42 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  26.79 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  26.79 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  26.79 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  26.79 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  26.79 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  25.1 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3219  hypothetical protein  44.32 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2070  hypothetical protein  26.52 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  29.1 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  24.58 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  24.58 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  24.58 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  24.76 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5633  hypothetical protein  25.27 
 
 
311 aa  67  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  26.23 
 
 
293 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1026  hypothetical protein  29.8 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.715879  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3485  hypothetical protein  29.8 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000551734  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  29.47 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  28.7 
 
 
277 aa  65.9  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  25.59 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  25.89 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  26.33 
 
 
298 aa  62.8  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  26.01 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  23.51 
 
 
301 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001475  permease  25.24 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.310077  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05416  hypothetical protein  24.13 
 
 
300 aa  59.7  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3483  hypothetical protein  25.76 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  0.164721 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4555  hypothetical protein  25.76 
 
 
314 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2109  hypothetical protein  25.56 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0115021  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  27.21 
 
 
295 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1390  hypothetical protein  23.98 
 
 
303 aa  56.6  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  26.44 
 
 
305 aa  56.6  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.57 
 
 
292 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  21.5 
 
 
303 aa  56.2  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 
291 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.23 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  27.75 
 
 
341 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  20.85 
 
 
302 aa  53.9  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.34 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1370  hypothetical protein  22.4 
 
 
321 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  0.119538 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  19.38 
 
 
302 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  22.92 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  25.32 
 
 
297 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  20.58 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  22.93 
 
 
303 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5820  hypothetical protein  24.06 
 
 
314 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803106  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.11 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3885  hypothetical protein  24.06 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4484  hypothetical protein  24.06 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  22.22 
 
 
286 aa  49.7  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  25.56 
 
 
298 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  25.86 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  22.79 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  25.86 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  24.53 
 
 
311 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.47 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  25 
 
 
319 aa  47  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  22.58 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  21.36 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  25.18 
 
 
297 aa  46.2  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>