147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2994 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  100 
 
 		 303 aa  601  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  75.83 
 
 		 302 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  74.83 
 
 		 302 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  70.9 
 
 		 303 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  76.66 
 
 		 302 aa  420  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  50.52 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  50.52 
 
 		 308 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  48.64 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  50.17 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.17 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  48.31 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  46.26 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  48.81 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  48.81 
 
 		 306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  47.19 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  48.31 
 
 		 306 aa  258  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  48.81 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.92 
 
 		 365 aa  252  6e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.44 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  48.4 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  48.56 
 
 		 307 aa  247  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  44.97 
 
 		 298 aa  241  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  46.85 
 
 		 287 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  48.57 
 
 		 308 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.9 
 
 		 292 aa  236  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  24.91 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  26.13 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  26.79 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  23.15 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.86 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25.57 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.65 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  27.09 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.37 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  22.11 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  22.95 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  24.83 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  32.08 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  27.16 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  26.07 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.22 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  27.67 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  22.77 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  25.89 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  26.27 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  27.6 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  27.61 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.18 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  27.13 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  22.22 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  23.61 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  27.18 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  29.03 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  25.29 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.88 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.53 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  24.48 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  29.52 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.29 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  25.53 
 
 		 314 aa  49.3  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 296 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  22.13 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  25 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  19.72 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  21.17 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  21.03 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  23.1 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  23.53 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  23.53 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  25.93 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.65 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  26.43 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  23.34 
 
 		 298 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  22.3 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  20.98 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  23.53 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  21.86 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  22.86 
 
 		 321 aa  45.8  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.02 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  20.2 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  20.2 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  24.66 
 
 		 327 aa  45.4  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  23.57 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  21.79 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  29.17 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  26.12 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  31.16 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.68 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  20.58 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  30.05 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  29.53 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>