74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2972 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  614  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  93.89 
 
 		 308 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  93.57 
 
 		 308 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  92.93 
 
 		 308 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  92.6 
 
 		 308 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  89.56 
 
 		 306 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  90.24 
 
 		 306 aa  497  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  90.91 
 
 		 306 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  90.57 
 
 		 306 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  70.43 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  73.21 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  69.97 
 
 		 303 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  72.14 
 
 		 308 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  72.83 
 
 		 307 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  51.25 
 
 		 302 aa  275  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  48.64 
 
 		 303 aa  275  7e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  49.5 
 
 		 303 aa  269  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  47.44 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  50.34 
 
 		 302 aa  263  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  46.84 
 
 		 301 aa  256  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.06 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  41.69 
 
 		 298 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.9 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  44.48 
 
 		 287 aa  218  7e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.36 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  25.09 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  24.81 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  25.16 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  24.81 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  29.86 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  24.09 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  23.99 
 
 		 287 aa  52.8  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  23.62 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  28.82 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  25.54 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  27.43 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27 
 
 		 295 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  23.79 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  29.57 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.18 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  29.31 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  26.42 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  23.4 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  29.17 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  27.88 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.89 
 
 		 281 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  28.14 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.88 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  28.21 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.48 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  26.86 
 
 		 303 aa  45.8  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  23.95 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  24.55 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  23.43 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  25.1 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0925  hypothetical protein  27.32 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0960  hypothetical protein  27.32 
 
 		 296 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.734629  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  24.21 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  26.26 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.56 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.69 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  24.21 
 
 		 327 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  26.12 
 
 		 279 aa  43.1  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  26.77 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  27.72 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.47 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  24 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  25.82 
 
 		 312 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.29 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2109  hypothetical protein  24.55 
 
 		 316 aa  42.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0115021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>