137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00560 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  100 
 
 		 302 aa  596  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  89.07 
 
 		 302 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  75.83 
 
 		 303 aa  468  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  77.63 
 
 		 303 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  77.78 
 
 		 302 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  52.03 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  52.78 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  53.38 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  47.16 
 
 		 301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  52.35 
 
 		 307 aa  262  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  47.44 
 
 		 311 aa  258  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  48.11 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  49.82 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  51.97 
 
 		 308 aa  255  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.11 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  49.47 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  48.65 
 
 		 306 aa  252  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  48.99 
 
 		 306 aa  252  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.41 
 
 		 299 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  47.62 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  47.96 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  47.52 
 
 		 298 aa  249  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.9 
 
 		 292 aa  246  4e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.18 
 
 		 365 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  45.91 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  26.47 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  26.04 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  24.67 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  23.43 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  26.71 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  24.49 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  24.47 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  26.35 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  23.45 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  21.71 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.43 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  23.11 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  26.52 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  24.58 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  27.78 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.49 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  23.17 
 
 		 288 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.4 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  23.4 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.74 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  24.58 
 
 		 307 aa  52.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  22.61 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  26.92 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  25.31 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  23.33 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  28.24 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  31.13 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  26.23 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  23.84 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.36 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  30.23 
 
 		 300 aa  49.7  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.09 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  21.53 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  21.53 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  30.82 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  21.36 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  26.72 
 
 		 299 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  21.49 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  26.72 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  26.72 
 
 		 299 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  25.52 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.84 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  26.26 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  25.45 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  22.18 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  26.47 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.75 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.67 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  21.53 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  22.55 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  24.88 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  21.53 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.8 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.64 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  21.36 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  24.05 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  22.1 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  22.18 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  24.55 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  23.75 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.71 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  21.84 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  22.95 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  22.95 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.25 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  34.18 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.4 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.61 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  23.34 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>