84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3467 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  586  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  44.22 
 
 
301 aa  265  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.25 
 
 
292 aa  264  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  47.52 
 
 
302 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  45.85 
 
 
302 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  44.97 
 
 
303 aa  241  9e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  47.04 
 
 
287 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  45.04 
 
 
306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.19 
 
 
299 aa  234  9e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  44.59 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  45.67 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  41.58 
 
 
304 aa  228  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.6 
 
 
365 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  44.16 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  41.69 
 
 
311 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  44.17 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  40.88 
 
 
308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  42.56 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  42.6 
 
 
307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.54 
 
 
308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  40.54 
 
 
308 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  40.54 
 
 
308 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  42.21 
 
 
306 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  41.87 
 
 
306 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  41.87 
 
 
306 aa  205  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 
281 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  23.73 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  23.29 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  25.61 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  29.37 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  26.95 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  29.87 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  23.05 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.86 
 
 
317 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  25.9 
 
 
300 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  31.82 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  22.39 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  26.5 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.3 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  23.43 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.41 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255385 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  24.19 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  24.19 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  24.19 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  24.19 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  24.19 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  24.19 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  23.81 
 
 
312 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  22.75 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.59 
 
 
296 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  26.64 
 
 
314 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  23.82 
 
 
305 aa  48.9  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  26.38 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.62 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  25.42 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.24 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  25.95 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  25.95 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.34 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  27.93 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  23.63 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.29 
 
 
287 aa  47  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  23.97 
 
 
288 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  23.02 
 
 
302 aa  45.8  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.4 
 
 
310 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.53 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  23.1 
 
 
319 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.18 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1845  DMT family permease  28.63 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  24.19 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  21.43 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  29.55 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  24.49 
 
 
288 aa  43.9  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  24.73 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  23.77 
 
 
287 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  23.02 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  25.91 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  23.34 
 
 
327 aa  43.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  22.48 
 
 
319 aa  43.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.02 
 
 
303 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  23.81 
 
 
311 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  23.57 
 
 
296 aa  42.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>