98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1802 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
365 aa  705    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  73.52 
 
 
287 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  51.69 
 
 
301 aa  276  4e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.51 
 
 
292 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  46.92 
 
 
303 aa  256  4e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  47.26 
 
 
303 aa  247  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  44.86 
 
 
302 aa  245  9e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  44.18 
 
 
302 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  46.93 
 
 
302 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  50 
 
 
303 aa  236  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.27 
 
 
299 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  41.02 
 
 
298 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  43.86 
 
 
306 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  46.67 
 
 
308 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  45.39 
 
 
304 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  44.68 
 
 
307 aa  212  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  42.36 
 
 
311 aa  209  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.06 
 
 
308 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  42.71 
 
 
308 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  42.36 
 
 
308 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  42.01 
 
 
308 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  43.4 
 
 
306 aa  205  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  43.4 
 
 
306 aa  202  9e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  43.4 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  43.4 
 
 
306 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.23 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  30.13 
 
 
294 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.76 
 
 
305 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 
291 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  28.05 
 
 
304 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  30.6 
 
 
293 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  27.65 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.69 
 
 
299 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 
309 aa  52.8  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
303 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 
291 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.34 
 
 
311 aa  51.2  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
281 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  27.18 
 
 
288 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  28.68 
 
 
309 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  30.42 
 
 
299 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25.89 
 
 
313 aa  49.7  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  25.97 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  28.57 
 
 
307 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  28.51 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.89 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  27.39 
 
 
314 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  29.05 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  28.51 
 
 
310 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  28.71 
 
 
290 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  27.68 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  31.28 
 
 
327 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  28.52 
 
 
280 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  27.72 
 
 
319 aa  47.4  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  28.52 
 
 
397 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 
307 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2007  hypothetical protein  28.49 
 
 
345 aa  47  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.21006  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.94 
 
 
309 aa  47  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  26.82 
 
 
315 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  26.29 
 
 
297 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
321 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  42.86 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  24.45 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  36.36 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  21.62 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4081  hypothetical protein  30.77 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  30.11 
 
 
284 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  21.48 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.61 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  30.46 
 
 
295 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  28.03 
 
 
302 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.13 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  24.08 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.23 
 
 
329 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  29.73 
 
 
324 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  26.32 
 
 
301 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  25.97 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.22 
 
 
314 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  25.19 
 
 
288 aa  43.5  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  23.14 
 
 
303 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  28.84 
 
 
289 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  23.14 
 
 
303 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  24.08 
 
 
308 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  26.13 
 
 
255 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.43 
 
 
312 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  30 
 
 
298 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.43 
 
 
312 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  23.58 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.22 
 
 
314 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  28.79 
 
 
330 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  24.57 
 
 
315 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  23.68 
 
 
303 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  25.32 
 
 
296 aa  42.7  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  35.06 
 
 
284 aa  42.7  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  23.58 
 
 
303 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>