91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2512 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  588  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  69.97 
 
 		 311 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  69.23 
 
 		 306 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  68.56 
 
 		 308 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  69.64 
 
 		 306 aa  393  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  70.23 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  67.89 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  67.89 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  70.23 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  71.92 
 
 		 304 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.23 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  69.9 
 
 		 306 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  72.14 
 
 		 308 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  71.01 
 
 		 307 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  52.03 
 
 		 302 aa  288  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  52.36 
 
 		 302 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  51.39 
 
 		 301 aa  280  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  52.1 
 
 		 303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  48.31 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  51.39 
 
 		 302 aa  263  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  45.67 
 
 		 298 aa  248  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.8 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.88 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  50.17 
 
 		 287 aa  228  7e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.03 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  24.43 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  29.41 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  27.34 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  27.38 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  29.63 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  25.19 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  28.52 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  25.78 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  25.1 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  26.56 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  27.78 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  28.87 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  25.09 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  26.42 
 
 		 287 aa  49.7  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.04 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  26.32 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  26.32 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  28.68 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  29.1 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 		 335 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  26.42 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  27.96 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  26.43 
 
 		 289 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  28.72 
 
 		 282 aa  46.6  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  25.43 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  28.18 
 
 		 321 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  23.47 
 
 		 298 aa  45.8  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.79 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.29 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.57 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  26.7 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.19 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  22.45 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  26.63 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  26.04 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  27.06 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  27.62 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  28.46 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  25.18 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  27.62 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  27.62 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  26.48 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  25.6 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  25.1 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  23.9 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  21.68 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  30.18 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 314 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  22.81 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  23.7 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 367 aa  42.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  31.11 
 
 		 302 aa  42.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  23.08 
 
 		 312 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  23.08 
 
 		 312 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  23.08 
 
 		 312 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  23.08 
 
 		 312 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  29.91 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  23.08 
 
 		 312 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  23.08 
 
 		 312 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>