More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2383 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.21 
 
 		 299 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  63.55 
 
 		 299 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  62.21 
 
 		 299 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  58.53 
 
 		 299 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  68.03 
 
 		 297 aa  322  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  54.85 
 
 		 298 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.35 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  29.09 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  30.43 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.59 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  30.2 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0825  hypothetical protein  30.77 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4618  hypothetical protein  31.65 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  34.66 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  31.99 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  25.48 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  30 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  31.7 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  24.71 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  24.71 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.84 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  24.71 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  24.71 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  24.71 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  24.41 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  28.19 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  24.71 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  29.26 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  24.71 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  29.26 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.26 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  29.26 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  29.26 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  29.26 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  29.26 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.71 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.62 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  28.89 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  27.7 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  29.1 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  26.84 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  26.96 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.16 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.46 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10380  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  23.88 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142725  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  28.68 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  29.54 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  28.26 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  28.47 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  29.27 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.43 
 
 		 310 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  31.37 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  28.72 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  29.23 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  29.56 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  28.72 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.73 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.09 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  28.91 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.56 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.87 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.09 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  26.52 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  28.78 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  31.98 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  28.12 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  26.77 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  27.72 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  25.86 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.86 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  28.91 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.59 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.413764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  29.48 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  28.42 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.19 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  25.46 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.36 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  26.53 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  29.79 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  26.62 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  30.19 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  32.18 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  28.47 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  27.57 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  27.89 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2363  hypothetical protein  26.03 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.847183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  23.83 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  28.18 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  31.38 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  28.95 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  28.57 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>