More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3402 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 299 aa  567  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  99 
 
 		 299 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0825  hypothetical protein  73.29 
 
 		 283 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  69.42 
 
 		 293 aa  345  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.96 
 
 		 296 aa  322  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4618  hypothetical protein  63.44 
 
 		 298 aa  309  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  50.35 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  49.12 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  32.18 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  30.89 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  30.6 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.27 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  28.78 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  30.57 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  28.41 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.48 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  27.89 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  27.89 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  25.46 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  27.46 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  27.46 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  27.46 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  28.01 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  27.46 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.27 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  27.27 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  27.27 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  27.27 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  27.27 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  29.23 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.74 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  30.14 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  26.41 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  33.07 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  28.52 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  28.87 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  28.52 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.34 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.413764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  28.46 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  24.18 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  25.62 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  25.62 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  30.5 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2654  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.9 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.24 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  24.64 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.32 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  28.2 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.2 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  28.2 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  28.2 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  28.2 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  28.2 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.94 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  28.2 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  23.67 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.67 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  24.9 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  27.82 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  28.64 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  33.52 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  27.82 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.67 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.44 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.32 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  33.52 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  25.17 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  25.09 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.32 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.67 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.35 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  28.73 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  28.73 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.35 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  28.52 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  29.72 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  22.9 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4262  hypothetical protein  29.15 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.04 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1098  hypothetical protein  29.85 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100036  normal  0.664944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  26.71 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  29.18 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  28.36 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  26.18 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  30.48 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  23.83 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  27.43 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  27.47 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>