More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4618 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4618  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  580  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.1 
 
 		 296 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.27 
 
 		 299 aa  340  2e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  63.27 
 
 		 299 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4695  hypothetical protein  63.1 
 
 		 293 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0825  hypothetical protein  58.36 
 
 		 283 aa  281  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  48.78 
 
 		 294 aa  255  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2852  hypothetical protein  48.79 
 
 		 304 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  33.45 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  32.5 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.04 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.6 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  29.21 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2383  hypothetical protein  30.53 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195914  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4236  putative transport protein  29.1 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172586  normal  0.870652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  27.78 
 
 		 298 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.1 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  29.66 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  27.17 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  24.75 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  25.18 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  24.18 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  28.28 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  28.28 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  28.28 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  28.28 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  28.28 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  28.28 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  28.28 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  27.84 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.78 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.413764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  27.11 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  27.11 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  27.04 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  24.32 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  27.04 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  27.04 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  27.04 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  23.55 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 		 293 aa  65.5  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.74 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1085  DMT superfamliy efflux pump  27.12 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.164203 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.85 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  28.85 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.27 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  23.21 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  26.67 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  26.1 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.38 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7634  DMT family permease  26.53 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.48827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02797  hypothetical protein  25.89 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.605573  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  30.71 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  22.83 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  27.34 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  27.34 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  27.34 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  28.93 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.43 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  30.08 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  27.08 
 
 		 335 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.07 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.81 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.81 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  28.07 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6034  hypothetical protein  32.08 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  28.07 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  23.21 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  28.07 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  25.64 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  28.07 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  25.44 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0592  hypothetical protein  32.08 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0410  hypothetical protein  27.82 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1376  hypothetical protein  25.91 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  22.81 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  27.37 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  24.47 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2734  hypothetical protein  31.13 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  25.5 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  25.5 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.43 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36480  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  28.68 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171631  normal  0.909358 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  21.76 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  26.27 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  21.76 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  26.48 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.81 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  28.76 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  24.39 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  27.85 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2707  hypothetical protein  31.13 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  22.43 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  24.39 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2095  hypothetical protein  31.13 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.734352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>