190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2435 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  593  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  77.63 
 
 		 302 aa  459  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  77.1 
 
 		 302 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  70.9 
 
 		 303 aa  432  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  74.22 
 
 		 302 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  52.1 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  50.83 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  49.5 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  46.38 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.17 
 
 		 308 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  50.85 
 
 		 306 aa  258  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  49.83 
 
 		 308 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  50.85 
 
 		 306 aa  258  9e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  51.02 
 
 		 306 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  49.83 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  50.85 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  51.6 
 
 		 306 aa  254  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  49.49 
 
 		 308 aa  254  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  50.54 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  51.79 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.26 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.52 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  44.59 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  48.07 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.98 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  28.97 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  28.82 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  27.87 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.45 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  25.86 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  28.47 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.95 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  26.78 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  27 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  24.77 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  23.98 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.52 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.66 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  23.29 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  23.29 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  26.45 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  26.04 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.98 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  25.61 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  25.43 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  23.42 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  25.54 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  23.03 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  30.6 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  24.77 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  26.26 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  24.05 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  28.18 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  26.29 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  25.44 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  26.75 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  22.82 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  22.82 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  25.52 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  27.59 
 
 		 314 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  27.73 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  27.73 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  27.73 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  26.75 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  25.78 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  27.2 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  25.26 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  25.26 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  27.2 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  25.26 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3558  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.43 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  25.9 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  25.27 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  27.89 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  27.2 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  27.96 
 
 		 322 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  26.32 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  25.34 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  26.11 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  25.5 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.22 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3019  hypothetical protein  27.17 
 
 		 330 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  26.3 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1950  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.3 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  25.25 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.91 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.46 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.39 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  25.44 
 
 		 314 aa  49.3  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  26.27 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  25.71 
 
 		 280 aa  49.7  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  23.61 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  23.23 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 		 312 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1589  hypothetical protein  28.38 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0342218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>