144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001929 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001929  permease  100 
 
 		 302 aa  592  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  89.07 
 
 		 302 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  74.83 
 
 		 303 aa  458  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  77.1 
 
 		 303 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  76.74 
 
 		 302 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  54.09 
 
 		 303 aa  280  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  52.78 
 
 		 304 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  53.74 
 
 		 306 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  51.25 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  50.52 
 
 		 308 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  47.65 
 
 		 301 aa  263  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  50.17 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  52.35 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.17 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  50.17 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  50.17 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  51.6 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  51.25 
 
 		 306 aa  258  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  51.61 
 
 		 308 aa  257  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  51.25 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  45.85 
 
 		 298 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.04 
 
 		 299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.21 
 
 		 292 aa  242  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.86 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  44.84 
 
 		 287 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  25.87 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  25.85 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  25.71 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  25.91 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.07 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  23.76 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25.34 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  23.44 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  23.44 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  22.57 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.92 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.44 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  26.69 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  23.44 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  26.57 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  28.81 
 
 		 343 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  24.92 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  23.81 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.35 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  21.84 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.81 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.28 
 
 		 295 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  21.84 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  28.81 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25.08 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  29.68 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.08 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.37 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  26.75 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  26.75 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  31.63 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  27.06 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  26.75 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  30.16 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  24.01 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  25.77 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  24.23 
 
 		 288 aa  49.3  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  21.75 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  24.81 
 
 		 284 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.42 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  28.81 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  24.24 
 
 		 321 aa  49.3  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.65 
 
 		 312 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  25.86 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  28.81 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  25.89 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  28.81 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.4 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.13 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  23.98 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  22.82 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.38 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  23.92 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  22.71 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  22.82 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  24.36 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  23.36 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  25.55 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  23.79 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1722  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.328831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  40.62 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  24.92 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  30.11 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  25.33 
 
 		 290 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  23.68 
 
 		 273 aa  46.2  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  22.48 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  28.38 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  23.36 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.67 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  28.38 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  28.38 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  21.53 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>