68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3538 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  98.38 
 
 
308 aa  600  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  99.03 
 
 
308 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  98.05 
 
 
308 aa  596  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  93.89 
 
 
311 aa  548  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  87.66 
 
 
306 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  90.76 
 
 
306 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  90.1 
 
 
306 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  90.43 
 
 
306 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  70.9 
 
 
304 aa  412  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  73.21 
 
 
306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  68.56 
 
 
303 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  71.1 
 
 
307 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  70.53 
 
 
308 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  50 
 
 
303 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  50.52 
 
 
302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  49.83 
 
 
303 aa  265  5.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  49.82 
 
 
302 aa  265  8e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  50.52 
 
 
302 aa  259  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  46.53 
 
 
301 aa  255  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.06 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.25 
 
 
299 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  40.88 
 
 
298 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  44.76 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.36 
 
 
365 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  26.79 
 
 
318 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  27.03 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  25.41 
 
 
300 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  29.86 
 
 
290 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  23.97 
 
 
296 aa  52.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  24.42 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  23.65 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.23 
 
 
292 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  24.52 
 
 
307 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  24.52 
 
 
307 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.53 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.31 
 
 
295 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  25.93 
 
 
290 aa  49.3  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  30.18 
 
 
294 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  27.24 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  31.14 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.83 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  24.62 
 
 
328 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  24 
 
 
288 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  29.17 
 
 
298 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.05 
 
 
296 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  26.8 
 
 
284 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  24.32 
 
 
300 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  24.57 
 
 
288 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4235  membrane protein  26.36 
 
 
291 aa  45.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  27.44 
 
 
306 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  29.77 
 
 
316 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  24 
 
 
319 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.37 
 
 
296 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  27.69 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  26.5 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  28.22 
 
 
292 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  24.35 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.43 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.66 
 
 
281 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2109  hypothetical protein  25.45 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0115021  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  23.75 
 
 
296 aa  43.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  24.73 
 
 
290 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 
317 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.69 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  29.33 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  27.93 
 
 
294 aa  42.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 
335 aa  42.4  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>