190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0384 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  597  1e-169  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  77.78 
 
 		 302 aa  441  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  76.74 
 
 		 302 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  76.66 
 
 		 303 aa  436  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  74.22 
 
 		 303 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  51.39 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  50.34 
 
 		 311 aa  269  4e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  50.52 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  50.52 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  47.92 
 
 		 301 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.17 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  49.31 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  50.17 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  49.16 
 
 		 306 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  49.5 
 
 		 306 aa  261  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  49.16 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  50.36 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  49.16 
 
 		 306 aa  259  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  51.07 
 
 		 308 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  49.28 
 
 		 307 aa  252  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.78 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.6 
 
 		 299 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.89 
 
 		 365 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  44.48 
 
 		 298 aa  235  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  45.71 
 
 		 287 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  28.67 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  28.4 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  26.6 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  26.09 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  28.67 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  27 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  25.56 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  25.62 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  27.39 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.03 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  25.87 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  24 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.3 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  24.36 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  25.61 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  25.61 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.73 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  23.64 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  23.29 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  22.9 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  27.31 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  23.73 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  24.05 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  31.25 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  27.64 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.88 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  27.76 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  26.64 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  27.59 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.51 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  26.13 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.76 
 
 		 325 aa  53.1  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  24.26 
 
 		 307 aa  53.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0267  hypothetical protein  26.54 
 
 		 306 aa  52.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.98 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  23.91 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  27.56 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  28.64 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  24.36 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.13 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  32.12 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  21.28 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  28.17 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  26.75 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  28.78 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  21.82 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  23.39 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  21.82 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  23.39 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  23.39 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  23.39 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  22.27 
 
 		 300 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  25.27 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4984  hypothetical protein  25.71 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.35217 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  25.28 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  22.22 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  21.75 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.32 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  22.27 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.06 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.26 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.687191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  24.37 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  29.47 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  23.77 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  22.27 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  27.61 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  27.61 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>