63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0958 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  599  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0956  hypothetical protein  99.35 
 
 		 306 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  98.69 
 
 		 306 aa  593  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  95.75 
 
 		 306 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3538  hypothetical protein  90.76 
 
 		 308 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.149446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  89.77 
 
 		 308 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  90.1 
 
 		 308 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3412  hypothetical protein  90.43 
 
 		 308 aa  522  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000352453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2972  hypothetical protein  90.91 
 
 		 311 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  70.57 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  74.29 
 
 		 306 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  70.23 
 
 		 303 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  73.93 
 
 		 308 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  69.44 
 
 		 307 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  49.66 
 
 		 303 aa  271  9e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  50.86 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  51.36 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  48.99 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  47.99 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  49.5 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.4 
 
 		 292 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0804  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.9 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.297153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  42.21 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  44.76 
 
 		 287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.4 
 
 		 365 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  29.73 
 
 		 290 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  26.72 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  24.15 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.14 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  24.61 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  24.61 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  24.28 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  24.57 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.97 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  25.71 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  23.57 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.43 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  30.18 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  28.88 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.15 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  25.78 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.47 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  26.21 
 
 		 284 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  27.59 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0579  hypothetical protein  26.53 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  29.17 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  26.72 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  29.17 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  29.29 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  28.08 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  25.71 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  28.36 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.4 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  31.08 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  26.56 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  24.91 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  24.64 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  26.97 
 
 		 298 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  25.13 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  23.6 
 
 		 283 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1857  hypothetical protein  39.62 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0328691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>