123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5123 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  568  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  73.26 
 
 		 294 aa  381  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  75.36 
 
 		 294 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  58.1 
 
 		 288 aa  296  4e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  60.98 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  62.88 
 
 		 290 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  58.57 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  59.93 
 
 		 284 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.27 
 
 		 295 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  52.86 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  54.33 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.93 
 
 		 288 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.48 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  54.45 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  58.78 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  53.21 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  49.49 
 
 		 300 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  61.36 
 
 		 289 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  53.99 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  45.77 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  45.77 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  53.21 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  39.6 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.25 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  38.59 
 
 		 314 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  37.46 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  44.41 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  37.55 
 
 		 289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  37.66 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  30.53 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.89 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  36.04 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3219  hypothetical protein  47.62 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  28.95 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  27.78 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  27.04 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  28.68 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  26.78 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  29.49 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  27.39 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  25.71 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  28.09 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  24.49 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  26.54 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2109  hypothetical protein  25.42 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0115021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3483  hypothetical protein  26.7 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  0.164721 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4555  hypothetical protein  26.7 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  31.55 
 
 		 277 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  30.14 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  25.49 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  25.29 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3485  hypothetical protein  30.2 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000551734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  26.07 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  27.14 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  30.2 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 365 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  30.99 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1026  hypothetical protein  29.87 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.715879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05416  hypothetical protein  29.65 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  34.43 
 
 		 319 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  30.42 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5633  hypothetical protein  29.92 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  27.84 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  27.84 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  30.6 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  27.84 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  27.84 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.84 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1129  hypothetical protein  32 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  28.52 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  27.84 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  27.84 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  27.75 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  27.84 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.91 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1390  hypothetical protein  27.01 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  27.49 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  27.49 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  26.9 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1172  hypothetical protein  32.41 
 
 		 304 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.26 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  27.12 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  28.65 
 
 		 328 aa  48.9  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.45 
 
 		 310 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.418767  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0303  hypothetical protein  36.36 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.193883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2070  hypothetical protein  26.6 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  25.57 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3055  hypothetical protein  28.14 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  25.19 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  31.34 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3467  hypothetical protein  23.63 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1125  integral membrane domain-containing protein  25.19 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01531  putative MadN protein  31.76 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  24.75 
 
 		 308 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0994  hypothetical protein  28.16 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0958  hypothetical protein  28.16 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1041  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.42 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132992  hitchhiker  0.00000125365 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>