93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3055 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3055  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  567  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3485  hypothetical protein  61.11 
 
 		 295 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000551734  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  60.76 
 
 		 295 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1026  hypothetical protein  60.76 
 
 		 295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.715879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  45.39 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  43.24 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  43.3 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  44.52 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  42.57 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  41.81 
 
 		 328 aa  201  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  42.95 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  41.11 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  37.76 
 
 		 302 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  40.41 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  40.41 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  40.41 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  39.25 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  36.18 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.73 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  40.07 
 
 		 293 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  39.32 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001475  permease  37.41 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.310077  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  39.32 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  39.32 
 
 		 307 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05416  hypothetical protein  38.11 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  39.73 
 
 		 293 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  39.38 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3885  hypothetical protein  37.16 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4484  hypothetical protein  37.16 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  39.34 
 
 		 274 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  39.34 
 
 		 274 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  39.34 
 
 		 274 aa  175  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5633  hypothetical protein  38.7 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5820  hypothetical protein  36.77 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  38.97 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  35.55 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2109  hypothetical protein  37.5 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0115021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1370  hypothetical protein  35.14 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  0.119538 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3483  hypothetical protein  34.84 
 
 		 314 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  0.164721 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4555  hypothetical protein  34.84 
 
 		 314 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1390  hypothetical protein  40.75 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2070  hypothetical protein  39.86 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1735  inner membrane protein YddG  45.22 
 
 		 162 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  36.3 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  32.32 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  31.34 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  30.51 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  35.38 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  29.02 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  29.46 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  29.46 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  32.53 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  31.91 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  32.6 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  30.68 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.08 
 
 		 294 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  32.33 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3820  hypothetical protein  30.73 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0151109  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2111  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.68 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  31.65 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.15 
 
 		 295 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  27.9 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  26.77 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  30.97 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  28.49 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  28.49 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  31.55 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.12 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  30.7 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  26.87 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  31.19 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  34.72 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  27.96 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  31.72 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  34.72 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  26.12 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  27.92 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  26.12 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.17 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  25.76 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  27.08 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  28.28 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  25.37 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  25.37 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  24.22 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  27.41 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3320  hypothetical protein  27.05 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.507234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>