83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1390 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1390  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2109  hypothetical protein  68.11 
 
 		 316 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0115021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3483  hypothetical protein  66.88 
 
 		 314 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  0.164721 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4555  hypothetical protein  66.88 
 
 		 314 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4623  hypothetical protein  67.58 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5633  hypothetical protein  67.12 
 
 		 311 aa  367  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1370  hypothetical protein  61.74 
 
 		 321 aa  362  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  0.119538 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  62.07 
 
 		 293 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  62.07 
 
 		 293 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.72 
 
 		 293 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  61.72 
 
 		 293 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  61.72 
 
 		 293 aa  352  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  59.79 
 
 		 303 aa  348  9e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  63.27 
 
 		 295 aa  345  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3885  hypothetical protein  61.49 
 
 		 321 aa  344  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4484  hypothetical protein  61.49 
 
 		 321 aa  344  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5820  hypothetical protein  61.15 
 
 		 314 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  63.1 
 
 		 307 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  63.1 
 
 		 293 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  63.1 
 
 		 307 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  63.1 
 
 		 293 aa  334  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  62.76 
 
 		 307 aa  333  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  62.13 
 
 		 274 aa  332  6e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  62.13 
 
 		 274 aa  332  6e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  62.13 
 
 		 274 aa  332  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2070  hypothetical protein  56.55 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  47.4 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  44.26 
 
 		 308 aa  263  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  47.57 
 
 		 298 aa  259  4e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  38.98 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001475  permease  42.86 
 
 		 300 aa  248  7e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.310077  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05416  hypothetical protein  41.84 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  44.93 
 
 		 277 aa  242  5e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  45.89 
 
 		 295 aa  241  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  49.14 
 
 		 297 aa  238  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  45.27 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  42.19 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  45.21 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1735  inner membrane protein YddG  59.35 
 
 		 162 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.763898  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3485  hypothetical protein  37.54 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000551734  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  42.47 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  37.19 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1026  hypothetical protein  37.19 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.715879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3055  hypothetical protein  40.75 
 
 		 301 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  28.23 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  29.45 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  26.8 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  24.3 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  24.83 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  23.49 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  25.95 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  29.08 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  27.78 
 
 		 288 aa  52.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  34.19 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  34.19 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  34.19 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  34.19 
 
 		 402 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  34.19 
 
 		 356 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.12 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  34.19 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.86 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  29.74 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  34.19 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  34.19 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.12 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  29.3 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  28.96 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  28.51 
 
 		 397 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  30.43 
 
 		 290 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  28.04 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  28.04 
 
 		 307 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.65 
 
 		 294 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  28.1 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  29.71 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  26.41 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  26.03 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  29.41 
 
 		 309 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  26.51 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  29.41 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>