122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2587 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2587  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  534  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0450  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.86 
 
 		 294 aa  322  6e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.267531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2060  hypothetical protein  63.83 
 
 		 294 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  hitchhiker  0.00448812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0506  hypothetical protein  61.46 
 
 		 290 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0252698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.79 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3690  hypothetical protein  57.54 
 
 		 288 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3079  hypothetical protein  56.03 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5123  hypothetical protein  59.93 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2554  hypothetical protein  54.64 
 
 		 296 aa  275  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.71 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7612  hypothetical protein  58.8 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.110479 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0304  hypothetical protein  58.11 
 
 		 290 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3062  hypothetical protein  57.74 
 
 		 288 aa  258  6e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0534  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.39 
 
 		 288 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  54.04 
 
 		 294 aa  254  9e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4039  Premeases of the drub/metabolic transporter protein  55.23 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  50.18 
 
 		 300 aa  242  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0507  hypothetical protein  58.11 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0394  hypothetical protein  52.8 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.236549  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3738  hypothetical protein  54.84 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6084  hypothetical protein  45.26 
 
 		 307 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6429  hypothetical protein  45.26 
 
 		 307 aa  179  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1798  hypothetical protein  44.29 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4887  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.37 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0240  hypothetical protein  42.28 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.904701 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0311  hypothetical protein  42.75 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.012738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0343  hypothetical protein  41.64 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.99772  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1560  hypothetical protein  45.13 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112464 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0186  hypothetical protein  34.89 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5668  hypothetical protein  33.2 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1646  hypothetical protein  33.8 
 
 		 321 aa  99.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.866595  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.72 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000163961  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3219  hypothetical protein  46.34 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.759716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1897  hypothetical protein  28.29 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2045  hypothetical protein  32.14 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000341344  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1593  hypothetical protein  30.04 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1686  hypothetical protein  30.04 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.605003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1749  hypothetical protein  30.04 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.880774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1771  hypothetical protein  30.04 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.860733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1688  hypothetical protein  30.04 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.355526 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.15 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.233434  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1556  hypothetical protein  27.15 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.137384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2084  hypothetical protein  27.15 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2190  hypothetical protein  29.15 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1701  hypothetical protein  27.15 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1653  hypothetical protein  26.82 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1959  hypothetical protein  31.52 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  26.79 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.28 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2825  hypothetical protein  29.22 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.693217  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0872  hypothetical protein  28.81 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  26.21 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  26.04 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3856  hypothetical protein  27.27 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1367  hypothetical protein  31.07 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1951  hypothetical protein  30.5 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0393459  normal  0.0245996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2056  hypothetical protein  28.63 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3584  hypothetical protein  25.26 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0998298  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01431  predicted methyl viologen efflux pump  26.83 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01443  hypothetical protein  26.83 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2058  hypothetical protein  28.57 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0938431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2184  hypothetical protein  26.83 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.733406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3410  hypothetical protein  26.64 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.708924  hitchhiker  0.00480919 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0557  hypothetical protein  30.54 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3233  hypothetical protein  28.76 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3357  hypothetical protein  30.1 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000721544  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  27.78 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1026  hypothetical protein  29.76 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.715879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1021  hypothetical protein  29.89 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3081  hypothetical protein  27.69 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  31.76 
 
 		 292 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3485  hypothetical protein  29.76 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000551734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2630  hypothetical protein  30.63 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.815333 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3483  hypothetical protein  28.1 
 
 		 314 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  0.164721 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4555  hypothetical protein  28.1 
 
 		 314 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  24.81 
 
 		 302 aa  49.3  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.65 
 
 		 309 aa  48.9  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2845  hypothetical protein  27.69 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2741  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.51 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2512  integral membrane domain-containing protein  27.38 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.106417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3406  hypothetical protein  28.51 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  31.91 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  30.13 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  23.5 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0400  hypothetical protein  29.28 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.552264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1235  carboxylate/amino acid/amine transporter  25 
 
 		 291 aa  46.2  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.82 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.51 
 
 		 365 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.39 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  27.4 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  31.48 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25.55 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  27.17 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.51 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.77 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0271281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  26.5 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  32.69 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  25.98 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>