131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0264 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  57.19 
 
 		 286 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  58.25 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  59.51 
 
 		 287 aa  299  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.71 
 
 		 287 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  58.1 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.11 
 
 		 295 aa  290  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.27 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.93 
 
 		 287 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  57.24 
 
 		 290 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  58.1 
 
 		 295 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.11 
 
 		 298 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  55.56 
 
 		 289 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  58.1 
 
 		 295 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  58.1 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  55.32 
 
 		 286 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  58.87 
 
 		 284 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  54.86 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  54.36 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  54.55 
 
 		 289 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  63.51 
 
 		 295 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  56.06 
 
 		 290 aa  275  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  61.73 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  56.69 
 
 		 285 aa  273  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.93 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  59.86 
 
 		 287 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  58.1 
 
 		 295 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  58.1 
 
 		 295 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  58.1 
 
 		 295 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  53.87 
 
 		 289 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  54.06 
 
 		 287 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  57.39 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  60.49 
 
 		 286 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.14 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.7 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  59.65 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.65 
 
 		 312 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.65 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  47.19 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  46.07 
 
 		 302 aa  201  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  45.71 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  45.36 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  44.64 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  49.13 
 
 		 313 aa  196  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  44.84 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  44.84 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  43.88 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  46.91 
 
 		 308 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  44.48 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  43.84 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  44.9 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  46.24 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  45.88 
 
 		 302 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  45.88 
 
 		 302 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  45.88 
 
 		 302 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  45.88 
 
 		 302 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  45.88 
 
 		 302 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  45.55 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  45.88 
 
 		 302 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  39.31 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.21 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.37 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  42.72 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  46.13 
 
 		 332 aa  175  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  41.91 
 
 		 300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  46.39 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  46.79 
 
 		 314 aa  168  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  42.28 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  42.35 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  41.11 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  44.48 
 
 		 318 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.8 
 
 		 320 aa  158  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  39.31 
 
 		 316 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.56 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.67 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  36.65 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.94 
 
 		 284 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  43.1 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.68 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  33.47 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  34.09 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  29.03 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0610  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 313 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.371435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  35.79 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  31.9 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.84 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.89 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.03 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  23.89 
 
 		 303 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.74 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  31.68 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.45 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2994  integral membrane protein  34.65 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  23.19 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  29.45 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8498  putative transmembrane protein  34.86 
 
 		 334 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  31.79 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>