130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4264 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  563  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  98.98 
 
 		 295 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  94.92 
 
 		 295 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  94.58 
 
 		 295 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  94.58 
 
 		 295 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  88.47 
 
 		 295 aa  490  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  92.54 
 
 		 295 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  77.21 
 
 		 295 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  80.42 
 
 		 295 aa  371  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  66.43 
 
 		 286 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  69.47 
 
 		 297 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.99 
 
 		 287 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.64 
 
 		 287 aa  359  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  65.03 
 
 		 286 aa  346  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  66.09 
 
 		 289 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  65.05 
 
 		 289 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.55 
 
 		 287 aa  342  5e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  67.25 
 
 		 287 aa  341  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  67.38 
 
 		 284 aa  341  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  64.36 
 
 		 289 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.16 
 
 		 287 aa  335  5e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  64.24 
 
 		 288 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  62.24 
 
 		 300 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  65.16 
 
 		 288 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  63.25 
 
 		 287 aa  325  8.000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  66.9 
 
 		 285 aa  322  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  65.14 
 
 		 290 aa  319  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  64.11 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  66.2 
 
 		 287 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  62.94 
 
 		 286 aa  285  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.11 
 
 		 296 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.53 
 
 		 298 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  60.65 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.07 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  67.07 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  59.18 
 
 		 295 aa  242  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  48.58 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.28 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  47.87 
 
 		 302 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  47.87 
 
 		 302 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  47 
 
 		 301 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.06 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  47.52 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  47.87 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  47.87 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  47.87 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  47.14 
 
 		 302 aa  211  9e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  47.52 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  47.52 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  47.52 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  47.52 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  47.52 
 
 		 302 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  46.81 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  46.81 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  48.15 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  49.8 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  42.96 
 
 		 304 aa  192  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  47.06 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  42.81 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  43.33 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  47.57 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.87 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  43.33 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  43.7 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  44.41 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  39.52 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.6 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  41.9 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  44.11 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  39.27 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.32 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  40.64 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  43.9 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.97 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  44.44 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.91 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  38.43 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.41 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  28.74 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  28.46 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 305 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 294 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  27.01 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  29.03 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  27.95 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.96 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.96 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.96 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.96 
 
 		 303 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.11 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.96 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.96 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 		 310 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.96 
 
 		 303 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>