143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3989 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 306 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  66.55 
 
 		 312 aa  307  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.14 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.48 
 
 		 312 aa  205  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.15 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  43.42 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  43.11 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  48.71 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  45.23 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  49.82 
 
 		 327 aa  195  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  43.46 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  48.9 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  44.03 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  44.03 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  46.24 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  43.56 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  43.56 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.12 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  43.42 
 
 		 302 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  42.47 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  46.24 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  42.86 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  42.05 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  46.59 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  46.59 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  47.37 
 
 		 295 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  45.77 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  43.21 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  43.2 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  40.67 
 
 		 304 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  43.56 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  42.21 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.88 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  43.93 
 
 		 313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  41.7 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  43.84 
 
 		 302 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  43.84 
 
 		 302 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  43.84 
 
 		 302 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  43.84 
 
 		 302 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  43.84 
 
 		 302 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  43.84 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  45.68 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  47.41 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  45.36 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.61 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  41.81 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.96 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  45.49 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  42.61 
 
 		 290 aa  175  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.09 
 
 		 287 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  41.99 
 
 		 288 aa  172  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  41.64 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  44.41 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  40.61 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  44.56 
 
 		 332 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.8 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.93 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  44.19 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  44.09 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  43.97 
 
 		 318 aa  165  6.9999999999999995e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  44.8 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  45.2 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  45.35 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  45.36 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  39.24 
 
 		 300 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  43.88 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  40.94 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  42.64 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.28 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  38.4 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.75 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.53 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  44.94 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  38.16 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.91 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  46.7 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  31.46 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.45 
 
 		 282 aa  116  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  30.1 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  29.52 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  21.49 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  31.1 
 
 		 325 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.07 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.07 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  24.34 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1716  hypothetical protein  28.04 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.889614  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  29.37 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  31.58 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  27.34 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  30.88 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2567  hypothetical protein  25.66 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  29.43 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.66 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  29.43 
 
 		 292 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.98 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>