108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2386 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  99.34 
 
 		 302 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  96.36 
 
 		 302 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  96.36 
 
 		 302 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  95.7 
 
 		 302 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  95.36 
 
 		 302 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  94.04 
 
 		 302 aa  549  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  88.04 
 
 		 302 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  86.71 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  86.71 
 
 		 302 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  86.71 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  86.71 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  86.71 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  86.71 
 
 		 302 aa  485  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  83.95 
 
 		 301 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  86.05 
 
 		 302 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  69.49 
 
 		 304 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.99 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.99 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  52.98 
 
 		 330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  50 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  53 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  49.26 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  44.3 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  49.63 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  49.63 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  49.26 
 
 		 295 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  48.89 
 
 		 295 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  43.62 
 
 		 286 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  47.16 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  43.4 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.49 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  41.36 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  42.66 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.89 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.05 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  41.5 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  47.91 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  42.57 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  42.36 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  44.15 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  41.58 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  41.16 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  47.49 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  46.46 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  40.64 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  42.22 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.48 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  44.06 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.62 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  41.52 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  41.94 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  43.2 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.87 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  40.89 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  45.64 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  39.8 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  40.37 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  42.21 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  40.48 
 
 		 290 aa  175  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  41.75 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.21 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  42.31 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  40.45 
 
 		 285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  42.91 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.62 
 
 		 295 aa  165  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.21 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  44.62 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  42.45 
 
 		 286 aa  158  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  35.86 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.9 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.05 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.28 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  32.64 
 
 		 300 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  43.35 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.15 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.18 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  28.72 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  31.96 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  33.62 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.48 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  27.51 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  28.88 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.39 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  29.78 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.7 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  36.84 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  30.73 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.26 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  37.18 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  35.35 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.05 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  37.18 
 
 		 353 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  37.18 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  25.84 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  37.18 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  37.18 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>