113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2511 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  82.57 
 
 		 330 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.13 
 
 		 312 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  71.48 
 
 		 312 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  74.17 
 
 		 313 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  54.42 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  53.67 
 
 		 302 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  53.67 
 
 		 302 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  53.67 
 
 		 302 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  52.84 
 
 		 302 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  53.67 
 
 		 302 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  53 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  53.87 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  53 
 
 		 302 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  53.9 
 
 		 302 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  53.9 
 
 		 302 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  53.9 
 
 		 302 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  53.9 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  53.9 
 
 		 302 aa  260  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  53.9 
 
 		 302 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  53.22 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  48.51 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  48.32 
 
 		 304 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  47.26 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.72 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  47.04 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.07 
 
 		 287 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  51.46 
 
 		 305 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  50.16 
 
 		 332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.12 
 
 		 287 aa  215  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  49.8 
 
 		 289 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.89 
 
 		 287 aa  215  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  45.99 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  50.39 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  50.39 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.72 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  46.21 
 
 		 289 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  44.77 
 
 		 313 aa  208  9e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  48.41 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  48.24 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.57 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  43.54 
 
 		 287 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.69 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  48.22 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  50.39 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  50.39 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  41.55 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  50.39 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  50 
 
 		 295 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  44.15 
 
 		 300 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.2 
 
 		 295 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  44.29 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  51.38 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  46.72 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  42.96 
 
 		 286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  47.75 
 
 		 287 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  46.39 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  46.55 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  46.85 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  43.79 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  46.47 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  44.2 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  47.52 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  50.98 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  44.01 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.84 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  44.93 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  45.83 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  46.98 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.78 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.02 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.24 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  49.24 
 
 		 295 aa  159  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  37.29 
 
 		 301 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  41.56 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.52 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.3 
 
 		 284 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  44.93 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.03 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.3 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  28.11 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  29.68 
 
 		 299 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  28.76 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0610  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.48 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.371435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  31.23 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  26.48 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.77 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2552  hypothetical protein  31.12 
 
 		 293 aa  46.6  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.46 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  31.44 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.94 
 
 		 315 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  20.65 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  29.54 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  29.77 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1076  hypothetical protein  34.67 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>