113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1302 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  593  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  69.46 
 
 		 301 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  69.54 
 
 		 302 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  69.49 
 
 		 302 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  69.49 
 
 		 302 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  69.21 
 
 		 302 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  68.54 
 
 		 302 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  69.49 
 
 		 302 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  69.83 
 
 		 302 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  71.19 
 
 		 302 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  69.8 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  69.46 
 
 		 302 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  69.8 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  69.8 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  69.8 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  70.21 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  69.8 
 
 		 302 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.62 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.3 
 
 		 312 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  48.05 
 
 		 330 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  46.82 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  47.84 
 
 		 327 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  43.66 
 
 		 297 aa  206  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  43.69 
 
 		 313 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  42.8 
 
 		 286 aa  201  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  42.16 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.45 
 
 		 314 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.09 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  42.16 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  44.15 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  43.94 
 
 		 295 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  44.53 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  40.64 
 
 		 287 aa  195  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  43.31 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  41.46 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  41.48 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  44.15 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  44.15 
 
 		 295 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  44.15 
 
 		 295 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  42.03 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  43.06 
 
 		 287 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  43.49 
 
 		 315 aa  191  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.94 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  43.55 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  41.3 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.02 
 
 		 295 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  44.53 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.01 
 
 		 287 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  44.26 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.6 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  45.04 
 
 		 314 aa  185  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  39.72 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  43.19 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  41.79 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  42.22 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  43.53 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.46 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  42.16 
 
 		 290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.97 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  41.67 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  44.53 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  41.06 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.57 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  43.02 
 
 		 295 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  39.29 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  37.33 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  39.55 
 
 		 332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.1 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.67 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  45.91 
 
 		 295 aa  162  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  43.18 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  40.15 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  36.08 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.57 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  34.98 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.96 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.9 
 
 		 284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  39 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.9 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  32.58 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  24.83 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  31.82 
 
 		 397 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.13 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.33 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.96 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.96 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  29.96 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  31.16 
 
 		 402 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  29.17 
 
 		 309 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  28.25 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  29.54 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  29.54 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  24.82 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  26.5 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  25.9 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  22.66 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  26.37 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  35.94 
 
 		 356 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>