151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4095 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  72.54 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  75.17 
 
 		 287 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  74.13 
 
 		 287 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.88 
 
 		 287 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  68.53 
 
 		 287 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  66.67 
 
 		 289 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  65.97 
 
 		 289 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  65.97 
 
 		 288 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  68.55 
 
 		 284 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  67.48 
 
 		 288 aa  358  5e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.58 
 
 		 295 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  65.73 
 
 		 295 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  64.58 
 
 		 289 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  67.29 
 
 		 295 aa  351  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  67.29 
 
 		 295 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67.48 
 
 		 287 aa  347  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  68.09 
 
 		 290 aa  347  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  66.43 
 
 		 295 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  66.43 
 
 		 295 aa  344  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  66.43 
 
 		 295 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  62.81 
 
 		 300 aa  343  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  63.03 
 
 		 287 aa  341  9e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  65.85 
 
 		 290 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  69.93 
 
 		 295 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  66.43 
 
 		 287 aa  335  7e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  66.08 
 
 		 295 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  58.74 
 
 		 286 aa  325  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  64.69 
 
 		 285 aa  325  8.000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.54 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  61.89 
 
 		 286 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  66.54 
 
 		 295 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  66.26 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.54 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  57.81 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  57.19 
 
 		 295 aa  255  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  45.94 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.97 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.65 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  43.62 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  41.87 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  41.87 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  41.87 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  43.62 
 
 		 302 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  48.34 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  43.62 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  48.72 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  42.55 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  44.67 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  47.42 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  45.77 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  45.77 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  45.77 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  45.77 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  45.77 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  45.77 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  45.77 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  42.8 
 
 		 304 aa  192  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  43.33 
 
 		 308 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.5 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  42.66 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  42.96 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  46.08 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  43.96 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  47.86 
 
 		 314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  44.33 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.42 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  44.72 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  40.51 
 
 		 316 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  37.59 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.05 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  37.14 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.84 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  38.4 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.75 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  38.13 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  42.18 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.03 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0532  hypothetical protein  28.91 
 
 		 303 aa  58.9  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24.55 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  24.55 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  24.11 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  24.11 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  24.55 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  26.55 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  24.55 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  24.11 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  24.11 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  24.11 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  24.55 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.19 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  27.65 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  22.22 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>