155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0402 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  597  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  84.56 
 
 		 318 aa  447  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  69.77 
 
 		 315 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.92 
 
 		 314 aa  362  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  70.92 
 
 		 314 aa  346  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  66.01 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  58.61 
 
 		 313 aa  308  8e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.97 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  54.96 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.71 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.38 
 
 		 312 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  41.48 
 
 		 304 aa  206  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  44.32 
 
 		 286 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  41.53 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  41.45 
 
 		 302 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  41.45 
 
 		 302 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  45.56 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  41.53 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  45 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  41.56 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  42.38 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  45.56 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  40.27 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  42.86 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  42.86 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  42.86 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  42.86 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  42.86 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  42.86 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  40.46 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  42.86 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  40.46 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  44.92 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  45 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  43.24 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  43.87 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.15 
 
 		 295 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  42.91 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  43.88 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  45.56 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  45.56 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  42.03 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  45.56 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  44.07 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  41.64 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  41.1 
 
 		 286 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  46.95 
 
 		 295 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  45.04 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.61 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  41.87 
 
 		 297 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  46.79 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  41.53 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  43.97 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  43.28 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.86 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  42.44 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 		 287 aa  172  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  43.64 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.59 
 
 		 287 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.7 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  39.56 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.39 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.22 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  43.7 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  39.8 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  37.63 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.82 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  36.12 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  40.89 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  45.82 
 
 		 295 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.89 
 
 		 287 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  43.46 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  43.46 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.36 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  40.91 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  41.74 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.16 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  40 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  30.45 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  28.41 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.17 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  29.64 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.17 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  28.85 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  28.85 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  28.85 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  28.02 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.41 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.1 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  26.47 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.09 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.09 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.73 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  29.6 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.53 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  25.63 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.61 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>