143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3844 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3844  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  588  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  99.36 
 
 
314 aa  586  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.594073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4235  hypothetical protein  73.38 
 
 
318 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3728  hypothetical protein  70.34 
 
 
315 aa  363  1e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0402  hypothetical protein  71.23 
 
 
311 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4436  hypothetical protein  74.58 
 
 
332 aa  352  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.785068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0184  hypothetical protein  59.93 
 
 
313 aa  288  6e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.482363  normal  0.823558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0746  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.5 
 
 
320 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3540  hypothetical protein  56.85 
 
 
308 aa  261  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0917  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.77 
 
 
312 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.77 
 
 
312 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0199053  normal  0.550765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0987  hypothetical protein  51.16 
 
 
313 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.0533863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5689  hypothetical protein  48.83 
 
 
302 aa  228  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0929  hypothetical protein  48.83 
 
 
302 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  0.616383 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2371  hypothetical protein  48.49 
 
 
302 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1738  hypothetical protein  48.49 
 
 
302 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2350  hypothetical protein  48.49 
 
 
302 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0952  hypothetical protein  49.83 
 
 
302 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2386  hypothetical protein  48.49 
 
 
302 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2268  hypothetical protein  48.49 
 
 
302 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1951  hypothetical protein  49.83 
 
 
302 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1002  hypothetical protein  49.83 
 
 
302 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0862  hypothetical protein  49.83 
 
 
302 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1164  integral membrane protein  49.83 
 
 
302 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0286  hypothetical protein  49.83 
 
 
302 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2116  hypothetical protein  47.49 
 
 
301 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363277  normal  0.146674 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1315  integral membrane protein, DUF6  49.5 
 
 
302 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1155  integral membrane protein  49.83 
 
 
302 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4095  hypothetical protein  47.1 
 
 
286 aa  215  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1302  hypothetical protein  46.78 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730648  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2511  hypothetical protein  50.97 
 
 
327 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2347  hypothetical protein  48.68 
 
 
330 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4790  hypothetical protein  47.23 
 
 
295 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.430049  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2732  hypothetical protein  46.15 
 
 
289 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3724  hypothetical protein  46 
 
 
295 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.212991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3554  hypothetical protein  43.84 
 
 
297 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4264  hypothetical protein  46.86 
 
 
295 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0105351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4886  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.42 
 
 
295 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240403  normal  0.615803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5402  hypothetical protein  47.23 
 
 
295 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3482  hypothetical protein  47.23 
 
 
295 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4884  hypothetical protein  47.23 
 
 
295 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.951172  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0259  hypothetical protein  45.35 
 
 
286 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2662  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.08 
 
 
287 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301286  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3085  hypothetical protein  43.34 
 
 
289 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0969  hypothetical protein  45.82 
 
 
290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0914  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.63 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.583051  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4837  hypothetical protein  45.94 
 
 
284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2949  hypothetical protein  44.23 
 
 
288 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_004310  BR1893  hypothetical protein  45.15 
 
 
285 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3061  hypothetical protein  43.46 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.608952  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2456  hypothetical protein  47.89 
 
 
312 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2334  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.73 
 
 
287 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0523768  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0829  hypothetical protein  47.27 
 
 
295 aa  179  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0472723 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2052  hypothetical protein  43.3 
 
 
288 aa  178  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0282096  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1783  drug/metabolite family efflux pump  50.58 
 
 
295 aa  177  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000148908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1638  hypothetical protein  37.42 
 
 
298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.2611  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3086  hypothetical protein  43.05 
 
 
300 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  43.17 
 
 
308 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1140  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.05 
 
 
301 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6291  hypothetical protein  48.69 
 
 
305 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0524409  normal  0.551804 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48150  hypothetical protein  44.37 
 
 
287 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1845  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.95 
 
 
287 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.278563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1891  hypothetical protein  46.9 
 
 
287 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.829047  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2978  conserved hypothetical protein membrane protein  41.58 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0254  hypothetical protein  45.73 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.663739  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7209  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.16 
 
 
298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0264  hypothetical protein  47.55 
 
 
295 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3989  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.55 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7474  putative inner membrane transport protein of unknown function  44.88 
 
 
286 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.450113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0052  hypothetical protein  40.2 
 
 
301 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4589  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.59 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0637  hypothetical protein  41.95 
 
 
300 aa  153  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4219  hypothetical protein  48.19 
 
 
295 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2148  transporter of the DMT superfamily  41.78 
 
 
316 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.470061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4736  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.64 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0137287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.25 
 
 
299 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1075  hypothetical protein  42.56 
 
 
317 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00290318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2011  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.02 
 
 
284 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.87899  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3600  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.18 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.593978  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  29.27 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.9 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.07 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.38 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.78 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  23.51 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.51 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.76 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.79 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.9 
 
 
303 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.51 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.6 
 
 
286 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.51 
 
 
303 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  24.3 
 
 
303 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.01 
 
 
314 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  28.78 
 
 
319 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  23.11 
 
 
303 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  28.79 
 
 
325 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  22.27 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  29.9 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>